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Enregistrement W3160870314 · doi:10.1186/s13195-021-00836-1

Validation of amyloid PET positivity thresholds in centiloids: a multisite PET study approach

2021· article· en· W3160870314 sur OpenAlexfundno aff
Sarah K. Royse, Davneet Minhas, Brian J. Lopresti, Alice Murphy, Tyler J. Ward, Robert A. Koeppe, Santiago Bullich, Susan DeSanti, William J. Jagust, Susan Landau

Notice bibliographique

RevueAlzheimer s Research & Therapy · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthGenentechIXICOH. Lundbeck A/SServierEisaiNorthern California Institute for Research and EducationBioClinicaF. Hoffmann-La RocheUniversity of Southern CaliforniaBiogenU.S. Department of DefenseMeso Scale DiagnosticsAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNovartis Pharmaceuticals CorporationPfizerEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbNational Institute on AgingAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of Health
Mots-clésPositron emission tomographyNeuroimagingNuclear medicineNeurologyDementiaBinding potentialWhite matterPipeline (software)PsychologyMedicineMedical physicsComputer scienceNeurosciencePathologyMagnetic resonance imagingDiseaseRadiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Inconsistent positivity thresholds, image analysis pipelines, and quantitative outcomes are key challenges of multisite studies using more than one β-amyloid (Aβ) radiotracer in positron emission tomography (PET). Variability related to these factors contributes to disagreement and lack of replicability in research and clinical trials. To address these problems and promote Aβ PET harmonization, we used [ 18 F]florbetaben (FBB) and [ 18 F]florbetapir (FBP) data from the Alzheimer’s Disease Neuroimaging Initiative (ADNI) to derive (1) standardized Centiloid (CL) transformations and (2) internally consistent positivity thresholds based on separate young control samples. Methods We analyzed Aβ PET data using a native-space, automated image processing pipeline that is used for PET quantification in many large, multisite AD studies and trials and made available to the research community. With this pipeline, we derived SUVR-to-CL transformations using the Global Alzheimer’s Association Interactive Network data; we used reference regions for cross-sectional (whole cerebellum) and longitudinal (subcortical white matter, brain stem, whole cerebellum) analyses. Finally, we developed a FBB positivity threshold using an independent young control sample ( N =62) with methods parallel to our existing FBP positivity threshold and validated the FBB threshold using a data-driven approach in ADNI participants ( N =295). Results The FBB threshold based on the young sample (1.08; 18 CL) was consistent with that of the data-driven approach (1.10; 21 CL), and the existing FBP threshold converted to CL with the derived transformation (1.11; 20 CL). The following equations can be used to convert whole cerebellum- (cross-sectional) and composite- (longitudinal) normalized FBB and FBP data quantified with the native-space pipeline to CL units: [ 18 F]FBB: CL whole cerebellum = 157.15 × SUVR FBB − 151.87; threshold=1.08, 18 CL [ 18 F]FBP: CL whole cerebellum = 188.22 × SUVR FBP − 189.16; threshold=1.11, 20 CL [ 18 F]FBB: CL composite = 244.20 × SUVR FBB − 170.80 [ 18 F]FBP: CL composite = 300.66 × SUVR FBP − 208.84 Conclusions FBB and FBP positivity thresholds derived from independent young control samples and quantified using an automated, native-space approach result in similar CL values. These findings are applicable to thousands of available and anticipated outcomes analyzed using this pipeline and shared with the scientific community. This work demonstrates the feasibility of harmonized PET acquisition and analysis in multisite PET studies and internal consistency of positivity thresholds in standardized units.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,022
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,041
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,115

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0220,041
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0020,001
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0020,003
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,109
Tête enseignante GPT0,417
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations234
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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