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Enregistrement W3161543281 · doi:10.1038/s41467-021-23186-w

RAS mutations drive proliferative chronic myelomonocytic leukemia via a KMT2A-PLK1 axis

2021· article· en· W3161543281 sur OpenAlexaff
Ryan M. Carr, Denis Vorobyev, Terra L. Lasho, David L. Marks, Ezequiel J. Tolosa, Alexis Vedder, Luciana L. Almada, Andrey Yurcheko, Ismaël Padioleau, Bonnie Alver, Giacomo Coltro, Moritz Binder, Stephanie L. Safgren, Isaac P. Horn, Xiaona You, Éric Solary, Maria E. Balasis, Kurt Berger, James W. Hiebert, Thomas E. Witzig, Ajinkya Buradkar, Temeida Graf, Peter Valent, Abhishek A. Mangaonkar, Keith D. Robertson, Matthew T. Howard, Scott H. Kaufmann, Christopher L. Pin, Martín E. Fernández-Zapico, Klaus Geißler, Nathalie Droin, Eric Padron, Jing Zhang, Sergey I. Nikolaev, Mrinal M. Patnaik

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAcute Myeloid Leukemia Research
Établissements canadiensLawson Health Research InstituteWestern University
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesConquer Cancer FoundationInstitut Gustave-RoussyAustrian Science FundGeorgia Clinical and Translational Science AllianceLigue Contre le CancerAmerican Society of Clinical OncologyNational Institutes of HealthHenry J. Predolin Foundation for Research in LeukemiaUniversity of Wisconsin Carbone Cancer CenterNational Cancer InstituteInstitut National Du Cancer
Mots-clésChronic myelomonocytic leukemiaCancer researchBiologyPLK1Myeloid leukemiaHistone H3NPM1EpigeneticsMutationMethyltransferaseLeukemiaDecitabineHistoneMethylationDNA methylationMolecular biologyGeneGeneticsCell cycleGene expressionImmunologyBone marrowMyelodysplastic syndromes

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Proliferative chronic myelomonocytic leukemia (pCMML), an aggressive CMML subtype, is associated with dismal outcomes. RAS pathway mutations, mainly NRAS G12D , define the pCMML phenotype as demonstrated by our exome sequencing, progenitor colony assays and a Vav-Cre - Nras G12D mouse model. Further, these mutations promote CMML transformation to acute myeloid leukemia. Using a multiomics platform and biochemical and molecular studies we show that in pCMML RAS pathway mutations are associated with a unique gene expression profile enriched in mitotic kinases such as polo-like kinase 1 ( PLK1). PLK1 transcript levels are shown to be regulated by an unmutated lysine methyl-transferase (KMT2A) resulting in increased promoter monomethylation of lysine 4 of histone 3. Pharmacologic inhibition of PLK1 in RAS mutant patient-derived xenografts, demonstrates the utility of personalized biomarker-driven therapeutics in pCMML.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,625
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,348
Écart entre enseignants0,323 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations100
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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