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Enregistrement W3162259891 · doi:10.1038/s41588-021-00857-4

Genome-wide association study of more than 40,000 bipolar disorder cases provides new insights into the underlying biology

2021· review· en· W3162259891 sur OpenAlexafffund
Niamh Mullins, Andreas J. Forstner, Kevin S. O’Connell, Brandon J. Coombes, Jonathan R. I. Coleman, Zhen Qiao, Thomas D. Als, Tim B. Bigdeli, Sigrid Børte, Julien Bryois, Alexander W. Charney, Ole Kristian Drange, Michael J. Gandal, Saskia P. Hagenaars, Masashi Ikeda, Nolan Kamitaki, Minsoo Kim, Kristi Krebs, Georgia Panagiotaropoulou, Brian M. Schilder, Laura Sloofman, Stacy Steinberg, Vassily Trubetskoy, Bendik S. Winsvold, Hong‐Hee Won, Liliya Abramova, Kristina Adorjan, Esben Agerbo, Mariam Al Eissa, Diego Albani, Ney Alliey‐Rodriguez, Adebayo Anjorin, Verneri Antilla, Anastasia Antoniou, Swapnil Awasthi, Ji Hyun Baek, Marie Bækvad‐Hansen, Nicholas Bass, Michael Bauer, Eva C. Beins, Sarah E. Bergen, Armin Birner, Carsten Bøcker Pedersen, Erlend Bøen, Marco P. Boks, Rosa Bosch, Murielle Brum, Ben Brumpton, Nathalie Brunkhorst-Kanaan, Monika Budde, Jonas Bybjerg‐Grauholm, William Byerley, Murray J. Cairns, Miguel Casas, Pablo Cervantes, Toni‐Kim Clarke, Cristiana Cruceanu, Alfredo B. Cuéllar‐Barboza, Julie M. Cunningham, David Curtis, Piotr M. Czerski, Anders M. Dale, Nina Dalkner, Friederike S. David, Franziska Degenhardt, Srdjan Djurovic, Amanda Dobbyn, Torbjørn Elvsåshagen, Valentina Escott‐Price, I. Nicol Ferrier, Alessia Fiorentino, Tatiana Foroud, Liz Forty, Josef Frank, Oleksandr Frei, Nelson B. Freimer, Louise Frisén, Katrin Gade, Julie Garnham, Joel Gelernter, Marianne Giørtz Pedersen, Ian R. Gizer, Scott D. Gordon, Katherine Gordon‐Smith, Tiffany A. Greenwood, Jakob Grove, José Guzmán‐Parra, Kyooseob Ha, Magnús Haraldsson, Martin Hautzinger, Urs Heilbronner, Dennis Hellgren, Stefan Herms, Per Hoffmann, Peter Holmans, Laura M. Huckins, Stéphane Jamain, Jessica Johnson, János Kálmán, James L. Kennedy, Sarah Kittel‐Schneider, James A. Knowles, Manolis Kogevinas, Maria Koromina, Thorsten M. Kranz, Henry R. Kranzler, Michiaki Kubo, Ralph Kupka, Steven A. Kushner, Catharina Lavebratt, Jacob Lawrence, Markus Leber, Heon‐Jeong Lee, Phil H. Lee, Shawn Levy, Calwing Liao, Susanne Lucae, Martin Lundberg, Donald J. MacIntyre, Sigurður H. Magnússon, Wolfgang Maier, Adam X. Maihofer, Dolores Malaspina, Eirini Maratou, Lina Martinsson, Manuel Mattheisen, Steven A. McCarroll, Nathaniel W. McGregor, Peter McGuffin, James McKay, Helena Medeiros, Sarah E. Medland, Vincent Millischer, Grant W. Montgomery, Jennifer L. Moran, Derek W. Morris, Thomas W. Mühleisen, Niamh L. O’Brien, Claire O’Donovan, Loes M. Olde Loohuis, Lilijana Oruč, Sergi Papiol, Antonio F. Pardiñas, Amy Perry, Andrea Pfennig, Evgenia Porichi, James B. Potash, Digby Quested, Towfique Raj, Mark Hyman Rapaport, J. Raymond DePaulo, Eline J. Regeer, John P. Rice, Fabio Rivas, Margarita Rivera, Julian Roth, Panos Roussos, Douglas M. Ruderfer, Cristina Sánchez‐Mora, Eva C. Schulte, Fanny Senner, Sally I. Sharp, Paul D. Shilling, Engilbert Sigurðsson, Lea Sirignano, Claire Slaney, Olav B. Smeland, Daniel J. Smıth, Janet L. Sobell, Christine Søholm Hansen, María Soler Artigas, Anne T. Spijker, Dan J. Stein, John S. Strauss, Beata Świątkowska, Chikashi Terao, Thorgeir E. Thorgeirsson, Claudio Toma, Paul A. Tooney, Evangelia Eirini Tsermpini, Marquis P. Vawter, Helmut Vedder, James Walters, Stephanie H. Witt, Simon Xi, Wei Xu, Jessica Yang, Allan H. Young, Hannah Young, Peter P. Zandi, Hang Zhou, Lea Zillich, Rolf Adolfsson, Ingrid Agartz, Martin Alda, Lars Alfredsson, Gulja Babadjanova, Lena Backlund, Bernhard T. Baune, Frank Bellivier, Susanne Bengesser, Wade H. Berrettini, Douglas Blackwood, Michael Boehnke, Anders D. Børglum, Gerome Breen, Vaughan J. Carr, Stanley V. Catts, Aiden Corvin, Nicholas Craddock, Udo Dannlowski, Dimitris Dikeos, Tõnu Esko, Bruno Étain, Panagiotis Ferentinos, Mark A. Frye, Janice M. Fullerton, Micha Gawlik, Elliot S. Gershon, Fernando S. Goes, Melissa J. Green, Maria Grigoroiu‐Serbânescu, Joanna Hauser, Frans A. Henskens, Jan Hillert, Kyung Sue Hong, David M. Hougaard, Christina M. Hultman, Kristian Hveem, Nakao Iwata, Assen Jablensky, Ian Jones, Lisa Jones, René S. Kahn, John R. Kelsoe, George Kirov, Mikael Landén, Marion Leboyer, Cathryn M. Lewis, Qingqin S. Li, Jolanta Lissowska, Christine Löchner, Carmel M. Loughland, Nicholas G. Martin, Carol A. Mathews, Fermín Mayoral, Susan L. McElroy, Andrew M. McIntosh, Francis J. McMahon, Ingrid Melle, Patricia T. Michie, Lili Milani, Philip B. Mitchell, Gunnar Morken, Ole Mors, Preben Bo Mortensen, Bryan Mowry, Bertram Müller‐Myhsok, R Myers, Benjamin M. Neale, Caroline M. Nievergelt, Merete Nordentoft, Markus M. Nöthen, Michael O‘Donovan, Ketil J. Øedegaard, Tomas Olsson, Michael J. Owen, Sara A. Paciga, Christos Pantelis, Carlos N. Pato, Michele T. Pato, George P. Patrinos, Roy H. Perlis, Daniëlle Posthuma, Josep Antoni Ramos‐Quiroga, Andreas Reif, Eva Z. Reininghaus, Marta Ribasés, Marcella Rietschel, Stephan Ripke, Guy A. Rouleau, Takeo Saito, Ulrich Schall, Martin Schalling, Peter R. Schofield, Thomas G. Schulze, Laura J. Scott, Rodney J. Scott, Alessandro Serretti, Cynthia Shannon Weickert, Jordan W. Smoller, Hreinn Stefánsson, Eystein Stordal, Fabian Streit, Patrick F. Sullivan, Gustavo Turecki, Eduard Vieta, John B. Vincent, Irwin D. Waldman, Thomas W. Weickert, Thomas Werge, Naomi R. Wray, John‐Anker Zwart, Joanna M. Biernacka, John I. Nürnberger, Sven Cichon, Howard J. Edenberg, Eli A. Stahl, Andrew McQuillin, Arianna Di Florio, Roel A. Ophoff, Ole A. Andreassen

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2021
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Associations and Epidemiology
Établissements canadiensPublic Health OntarioMcGill UniversityDalhousie UniversityMontreal Neurological Institute and HospitalUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental HealthMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilInstitute of Psychiatry, Psychology and Neuroscience, King’s College LondonSchool of Medicine, Emory UniversityNational Institutes of HealthUniversité de ParisAssistance publique-Hôpitaux de ParisUniversity of Cape TownCentre d'Imagerie BioMédicaleUniversitat de BarcelonaHáskóli ÍslandsUniversitetet i OsloUmeå UniversitetUniversity of California, IrvineUniversidad Autónoma de MadridMcDonnell Center for Systems NeuroscienceUniversity of MelbourneUniversity of TorontoUniversity of GlasgowUniversity of New South WalesSouth African Medical Research CouncilUniversidad de GranadaKarolinska InstitutetSchool of Medicine, University of California, IrvineLundbeckfondenInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleEmory UniversityWestfälische Wilhelms-Universität MünsterUniversity of OxfordNeuroscience Research AustraliaVanderbilt UniversityKing's College LondonDiakonhjemmetCentro de Biología Molecular Severo OchoaVanderbilt University Medical CenterPfizerNational Institute for Health and Care ResearchAgence Nationale de la RechercheUniversity of Southern CaliforniaWorld Health OrganizationU.S. Department of Health and Human Services
Mots-clésBiologyGenome-wide association studyComputational biologyBipolar disorderGeneticsGenetic associationGenomeAssociation (psychology)Evolutionary biologySingle-nucleotide polymorphismGeneGenotypeNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bipolar disorder is a heritable mental illness with complex etiology. We performed a genome-wide association study of 41,917 bipolar disorder cases and 371,549 controls of European ancestry, which identified 64 associated genomic loci. Bipolar disorder risk alleles were enriched in genes in synaptic signaling pathways and brain-expressed genes, particularly those with high specificity of expression in neurons of the prefrontal cortex and hippocampus. Significant signal enrichment was found in genes encoding targets of antipsychotics, calcium channel blockers, antiepileptics and anesthetics. Integrating expression quantitative trait locus data implicated 15 genes robustly linked to bipolar disorder via gene expression, encoding druggable targets such as HTR6, MCHR1, DCLK3 and FURIN. Analyses of bipolar disorder subtypes indicated high but imperfect genetic correlation between bipolar disorder type I and II and identified additional associated loci. Together, these results advance our understanding of the biological etiology of bipolar disorder, identify novel therapeutic leads and prioritize genes for functional follow-up studies. Genome-wide association analyses of 41,917 bipolar disorder cases and 371,549 controls of European ancestry provide new insights into the etiology of this disorder and identify novel therapeutic leads and potential opportunities for drug repurposing.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,002

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,310 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1 593
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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