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Enregistrement W3162412060 · doi:10.1186/s13071-021-04750-1

Monitoring the patterns of submission and presence of tick-borne pathogens in Ixodes scapularis collected from humans and companion animals in Ontario, Canada (2011–2017)

2021· article· en· W3162412060 sur OpenAlexaffabout
Mark P. Nelder, Curtis Russell, Antonia Dibernardo, Katie M. Clow, Steven Ross Johnson, Kirby Cronin, Samir N. Patel, L. Robbin Lindsay

Notice bibliographique

RevueParasites & Vectors · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueVector-borne infectious diseases
Établissements canadiensToronto Public HealthUniversity of GuelphPublic Health Agency of CanadaUniversity of TorontoPublic Health Ontario
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésIxodes scapularisBorrelia burgdorferiAnaplasma phagocytophilumTickBiologyLyme diseaseBorreliaTick-borne diseaseIxodesBabesiosisVeterinary medicineBabesiaAnaplasmosisAnaplasmaVirologyIxodidaeImmunologyMedicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: The universal nature of the human-companion animal relationship and their shared ticks and tick-borne pathogens offers an opportunity for improving public and veterinary health surveillance. With this in mind, we describe the spatiotemporal trends for blacklegged tick (Ixodes scapularis) submissions from humans and companion animals in Ontario, along with pathogen prevalence. METHODS: We tested tick samples submitted through passive surveillance (2011-2017) from humans and companion animals for Borrelia burgdorferi, Borrelia miyamotoi, Anaplasma phagocytophilum and Babesia microti. We describe pathogen prevalence in ticks from humans and from companion animals and constructed univariable Poisson and negative binomial regression models to explore the spatiotemporal relationship between the rates of tick submissions by host type. RESULTS: During the study, there were 17,230 blacklegged tick samples submitted from humans and 4375 from companion animals. Tick submission rates from companion animals were higher than expected in several public health units (PHUs) lacking established tick populations, potentially indicating newly emerging populations. Pathogen prevalence in ticks was higher in PHUs where established blacklegged tick populations exist. Borrelia burgdorferi prevalence was higher in ticks collected from humans (maximum likelihood estimate, MLE = 17.5%; 95% confidence interval, CI 16.97-18.09%) than from companion animals (9.9%, 95% CI 9.15-10.78%). There was no difference in pathogen prevalence in ticks by host type for the remaining pathogens, which were found in less than 1% of tested ticks. The most common co-infection B. burgdorferi + B. miyamotoi occurred in 0.11% of blacklegged ticks from humans and animals combined. Borrelia burgdorferi prevalence was higher in unengorged (21.9%, 95% CI 21.12-22.65%) than engorged ticks (10.0%, 95% CI 9.45-10.56%). There were no consistent and significant spatiotemporal relationships detected via regression models between the annual rates of submission of each host type. CONCLUSIONS: While B. burgdorferi has been present in blacklegged ticks in Ontario for several decades, other tick-borne pathogens are also present at low prevalence. Blacklegged tick and pathogen surveillance data can be used to monitor risk in human and companion animal populations, and efforts are under consideration to unite surveillance efforts for the different target populations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,565

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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