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Enregistrement W3162770821 · doi:10.1111/mec.15977

Ancient horse genomes reveal the timing and extent of dispersals across the Bering Land Bridge

2021· article· en· W3162770821 sur OpenAlexafffund
Alisa O. Vershinina, Peter D. Heintzman, Duane Froese, Grant D. Zazula, Molly Cassatt‐Johnstone, Love Dalén, Clio Der Sarkissian, Shelby Dunn, Luca Ermini, Cristina Gamba, Pamela Groves, Joshua D. Kapp, Daniel H. Mann, Andaine Seguin‐Orlando, John Southon, Mathias Stiller, Matthew J. Wooller, Gennady Baryshnikov, Д. О. Гимранов, Eric Scott, Elizabeth Hall, Susan Hewitson, Irina Kirillova, П. А. Косинцев, Fedor Shidlovsky, Haowen Tong, Mikhail P. Tiunov, Sergey Vartanyan, Ludovic Orlando, Russell Corbett‐Detig, R. D. E. MacPhee, Beth Shapiro

Notice bibliographique

RevueMolecular Ecology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueWildlife Ecology and Conservation
Établissements canadiensCanadian Museum of NatureYukon Department of Tourism and CultureUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesU.S. Bureau of Land ManagementVetenskapsrådetScience for Life LaboratoryNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaKnut och Alice Wallenbergs StiftelseRussian Academy of SciencesRussian Foundation for Basic ResearchUppsala Multidisciplinary Center for Advanced Computational ScienceSvenska Forskningsrådet FormasEuropean CommissionUniversity of California, Santa CruzGordon and Betty Moore FoundationNational Science Foundation
Mots-clésBiologyLand bridgeBridge (graph theory)Ancient DNAGenomeEcologyEvolutionary biologyBiological dispersalGeneticsPopulationGeneDemography

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Bering Land Bridge (BLB) last connected Eurasia and North America during the Late Pleistocene. Although the BLB would have enabled transfers of terrestrial biota in both directions, it also acted as an ecological filter whose permeability varied considerably over time. Here we explore the possible impacts of this ecological corridor on genetic diversity within, and connectivity among, populations of a once wide-ranging group, the caballine horses (Equus spp.). Using a panel of 187 mitochondrial and eight nuclear genomes recovered from present-day and extinct caballine horses sampled across the Holarctic, we found that Eurasian horse populations initially diverged from those in North America, their ancestral continent, around 1.0-0.8 million years ago. Subsequent to this split our mitochondrial DNA analysis identified two bidirectional long-range dispersals across the BLB ~875-625 and ~200-50 thousand years ago, during the Middle and Late Pleistocene. Whole genome analysis indicated low levels of gene flow between North American and Eurasian horse populations, which probably occurred as a result of these inferred dispersals. Nonetheless, mitochondrial and nuclear diversity of caballine horse populations retained strong phylogeographical structuring. Our results suggest that barriers to gene flow, currently unidentified but possibly related to habitat distribution across Beringia or ongoing evolutionary divergence, played an important role in shaping the early genetic history of caballine horses, including the ancestors of living horses within Equus ferus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,174

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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