Transcriptome-wide association study uncovers the role of essential genes in anthracycline-induced cardiotoxicity
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Anthracyclines are highly effective chemotherapeutic agents; however, their clinical utility is limited by severe anthracycline-induced cardiotoxicity (ACT). Genome-wide association studies (GWAS) have uncovered several genetic variants associated with ACT, but the impact of these findings requires further elucidation. We conducted a transcriptome-wide association study (TWAS) using our previous GWAS summary statistics ( n = 280 patients) to identify gene expression-related associations with ACT. We identified a genetic association between decreased expression of GDF5 and ACT ( Z -score = −4.30, P = 1.70 × 10 −5 ), which was replicated in an independent cohort ( n = 845 patients, P = 3.54 × 10 −3 ). Additionally, cell viability of GDF5 -silenced human cardiac myocytes was significantly decreased in response to anthracycline treatment. Subsequent gene set enrichment and pathway analyses of the TWAS data revealed that genes essential for survival, cardioprotection and response to anthracyclines, as well as genes involved in ribosomal, spliceosomal and cardiomyopathy pathways are important for the development of ACT.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».