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Enregistrement W3163604188 · doi:10.1096/fasebj.2021.35.s1.03655

Antimicrobial Activity Of A Histone Derived Peptide In The Airway Surface Liquid

2021· article· en· W3163604188 sur OpenAlexaff
Matthew Biggart, Kai Hilpert, Robert Tarren, Deborah L. Baines

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThapsigarginHistoneCell biologyExtracellularViability assayBiologyInnate immune systemIntracellularCellImmunologyImmune systemBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Extracellular histones are viewed as cytotoxic markers in cell death, apoptosis and NETosis. However, extracellular histones have been found to carry out a number of roles outside their function as a damage associated molecular patterns to signal cell death. Extracellular histones have been seen to act as an early release marker of cell stress, influence cell growth, have antimicrobial activity and bioactive peptides. A suggested method for the intentional secretion of histones has been show through amphisomes, with histones being present in the proteome of healthy biological systems. Airway surface liquid (ASL), present in the lumen of the airways plays a critical role in airway defense and innate immunity. We identified a number of histone derived peptides by de novo peptide sequencing of the airway surface liquid. In ASL overlying H441, Calu3 and BMI‐1 transduced human bronchial epithelial cells (HBEC) we identified similar histone peptides. This was supported by their presence in sputum samples from people with and without Cystic Fibrosis disease. To test whether the ASL histone peptides had a bioactive role we produced synthetic analogues using SPOT peptide synthesis. The peptides were then tested for effects on human embryonic kidney (HEK 293) cell growth, viability and intracellular Ca 2+ [Ca2+]i. One candidate, MAT9 when screened suppressed the rise in [Ca2+]i in response to thapsigargin (p=0.001, n=8 with 16 replicates), but did not affect cell viability or cell growth. When MAT9 (10µM) was tested on H441 airway epithelial cells, it increased the thapsigargin‐induced rise in [Ca2+]i (P=0.01, n=6, with 12 replicates). This difference in calcium response could be due to a lack of toll‐like receptors (known receptors for histone proteins) in HEK cells which are present in H441 cells. Alongside this MAT9 (10µM) inhibited growth of luminescent Pseudomonas aeruginosa and was able to significantly reduce the growth rate over 4 hours at 5µM (P=0.01, n=4, with 16 replicates). Outside of this antibacterial activity, preliminary data showed some activity against Sars‐Cov2 replication in Caco‐2 cells. This data indicates that MAT9 is a histone derived peptide with bioactivity, and its proline‐alanine sequence may represent a chance to enhance this activity by changing its isomerization.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,257
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2021
Routes d'admission1
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