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Enregistrement W3163801212 · doi:10.1158/2159-8290.cd-20-1690

Proteomic Screens for Suppressors of Anoikis Identify IL1RAP as a Promising Surface Target in Ewing Sarcoma

2021· article· en· W3163801212 sur OpenAlexafffund
Haifeng Zhang, Christopher S. Hughes, Wei Li, Jianzhong He, Didier Surdez, Amal M. El-Naggar, Hongwei Cheng, Anna Prudova, Alberto Delaidelli, Gian Luca Negri, Xiaojun Li, Maj Sofie Ørum-Madsen, Michael M. Lizardo, Htoo Zarni Oo, Shane Colborne, Taras Shyp, Renata Scopim‐Ribeiro, Colin A. Hammond, Anne-Chloé Dhez, Sofya Langman, Jonathan Lim, Sonia H.Y. Kung, Amy Li, Anne Steinø, Mads Daugaard, Ramon I. Klein Geltink, Rimas J. Orentas, Li‐Yan Xu, Gregg B. Morin, Olivier Delattre, Dimiter S. Dimitrov, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueCancer Discovery · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British ColumbiaBC Children's HospitalBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthLotte and John Hecht Memorial FoundationNational Cancer InstituteSt. Baldrick's Foundation
Mots-clésAnoikisEwing's sarcomaSuppressorCancer researchSarcomaBiologyComputational biologyBioinformaticsMedicineCancerGeneticsPathologyMetastasis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cancer cells must overcome anoikis (detachment-induced death) to successfully metastasize. Using proteomic screens, we found that distinct oncoproteins upregulate IL1 receptor accessory protein (IL1RAP) to suppress anoikis. IL1RAP is directly induced by oncogenic fusions of Ewing sarcoma, a highly metastatic childhood sarcoma. IL1RAP inactivation triggers anoikis and impedes metastatic dissemination of Ewing sarcoma cells. Mechanistically, IL1RAP binds the cell-surface system Xc− transporter to enhance exogenous cystine uptake, thereby replenishing cysteine and the glutathione antioxidant. Under cystine depletion, IL1RAP induces cystathionine gamma lyase (CTH) to activate the transsulfuration pathway for de novo cysteine synthesis. Therefore, IL1RAP maintains cyst(e)ine and glutathione pools, which are vital for redox homeostasis and anoikis resistance. IL1RAP is minimally expressed in pediatric and adult normal tissues, and human anti-IL1RAP antibodies induce potent antibody-dependent cellular cytotoxicity of Ewing sarcoma cells. Therefore, we define IL1RAP as a new cell-surface target in Ewing sarcoma, which is potentially exploitable for immunotherapy. Significance: Here, we identify cell-surface protein IL1RAP as a key driver of metastasis in Ewing sarcoma, a highly aggressive childhood sarcoma. Minimal expression in pediatric and adult normal tissues nominates IL1RAP as a promising target for immunotherapy. See related commentary by Yoon and DeNicola, p. 2679 . This article is highlighted in the In This Issue feature, p. 2659

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,476

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,327
Écart entre enseignants0,308 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations109
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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