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Enregistrement W3164128687 · doi:10.3389/fphar.2021.679456

Identification of Docetaxel as a Potential Drug to Promote HDL Biogenesis

2021· article· en· W3164128687 sur OpenAlexafffund
Hong Y. Choi, Isabelle L. Ruel, Jacques Genest

Notice bibliographique

RevueFrontiers in Pharmacology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer, Lipids, and Metabolism
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMcGill University Health CentreMcGill University
Mots-clésDocetaxelBiogenesisChemistryTaxaneDocking (animal)Virtual screeningPharmacologyDrugIn silicoPotencyCytotoxicityPlasma protein bindingBiochemistryCancer researchIn vitroCell biologyDrug discoveryBiologyChemotherapyMedicineCancerGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Objective: Our recent studies showed that desmocollin 1 (DSC1) binds to apoA-I in order to inhibit apoA-I-mediated high density lipoprotein (HDL) biogenesis in atherosclerotic plaques. To promote HDL biogenesis in the plaque, here we search for small molecules that block apoA-I-DSC1 interactions. Approach and Results: We combined mutational and computational mapping methods to show that amino acid residues 442–539 in the mature DSC1 protein form an apoA-I binding site (AIBS). Using a crystal structure of the AIBS, we carried out virtual screening of 10 million small molecules to estimate their binding affinities to the AIBS, followed by the selection of 51 high-affinity binding molecules as potential inhibitors of apoA-I-DSC1 interactions. Among the 51, the chemotherapy drug docetaxel showed the highest potency in promoting apoA-I-mediated HDL biogenesis in primary human skin fibroblasts with the half-maximal effective concentration of 0.72 nM. In silico docking studies suggest that the taxane ring in docetaxel binds to the AIBS and that the carbon-13 sidechain of the taxane tightens/stabilizes the binding. The HDL biogenic effect of docetaxel was also observed in two predominant cell types in atherosclerosis, macrophages and smooth muscle cells. Importantly, docetaxel promoted HDL biogenesis at concentrations much lower than those required for inducing cytotoxicity. Conclusion: Determination of the AIBS in DSC1 and AIBS structure-based virtual screening allowed us to identify docetaxel as a strong HDL biogenic agent. With the remarkable potency in promoting HDL biogenesis, a chemotherapy drug docetaxel may be repurposed to enhance atheroprotective HDL functions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,128
Score d'incertitude au seuil0,585

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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