Two Imported Cases of New Variant COVID-19 First Emerging from Brazil — Guangdong Province, China, April 30, 2021
Notice bibliographique
Résumé
On April 15, 2021, a 62-year-old male (Patient A, XG4122) and a 58-year-old female (Patient B, XG4123) travelled from Canada via airplane and were transferred to a central isolation hotel after being tested by the laboratory of Guangzhou Customs using nose swab tests for coronavirus disease 2019 (COVID-19).The results for both patients returned COVID-19 positive and the couple were transported to the Guangzhou Eighth People's Hospital for isolated treatment by ambulance on April 16, 2021.Patient A had inflamed lungs while Patient B had mild inflammation in her lungs according to the chest computed tomography (CT) examination.Both of their 28 close contacts underwent centralized isolation and medical observation.On April 21, 2021, Guangdong Provincial CDC received the samples and began virus isolation and gene sequencing analysis.On April 27, 2021, the 2 samples were sequenced using Nanopore GridION.On April 30, 2021, the sequencing analysis concluded that the 2 virus genomes belonged to lineage P.1, 20J/501Y.V3, which was first found in four Brazilians after a routine check at Japan's Haneda Airport in late December 2020.The variant was then widely spread to Manaus in the northern State of Amazona in Brazil.The Brazil variant has been reported in 40 different countries as of April 30, 2021(1).Compared with the Wuhan reference sequence (EPI_ISL_402119) (2-3), the strain from Patient A (XG4122) displayed 33 nucleotide variation sites (C241T, T733C, C2749T, C3037T, C3828T, A5648C, A6319G, A6613G, G9105A, C12778T, C14408T
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».