The role of single nucleotide polymorphisms of IL-1A -889C>T (rs1800587), TNF-A -238G>A (rs361525), and VDR TaqI (rs731236) on susceptibility to herniated nucleus pulposus
Notice bibliographique
Résumé
<ns4:p> <ns4:bold>Background</ns4:bold> : The objective of this study was to determine the role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in interleukin 1 alpha ( <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> ), tumor necrosis factor-alpha ( <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> ), and vitamin D receptor ( <ns4:italic>VDR</ns4:italic> ) genes on the susceptibility to herniated nucleus pulposus (HNP). </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Methods</ns4:bold> : Four databases (PubMed, Embase, Cochrane, and Web of Science) were searched as of April 1 <ns4:sup>st</ns4:sup> , 2021. Authors, publication year, targeted genes, genotype and allele frequency in each case and control groups were collected. Newcastle-Ottawa scale was used to evaluate the publication quality. The pooled estimates of association of <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C>T (rs1800587), <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G>A (rs361525), and <ns4:italic>VDR TaqI</ns4:italic> (rs731236) and susceptibility to HNP were assessed using Z test and presented as odd ratio (OR) and 95% confidence intervals (95%CI). </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Results</ns4:bold> : We screened 3,067 unique studies for eligibility and three, two and nine studies on <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C>T, <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G>A, and <ns4:italic>VDR TaqI</ns4:italic> were included, respectively, in our meta-analysis. The studies consisting 369 HNP cases and 433 controls for <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C>T, 252 cases and 259 controls for <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G>A and 1130 cases and 2096 controls for <ns4:italic>VDR TaqI.</ns4:italic> Our pooled estimates indicated that there was no significant association of those SNPs with the susceptibility to HNP in any genotype, dominant model, recessive model, or allele comparations. </ns4:p> <ns4:p> <ns4:bold>Conclusion</ns4:bold> : Although individual studies suggested the important role of gene expression dysregulation associated with SNPs in <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> , <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> , and <ns4:italic>VDR</ns4:italic> , our data indicated that <ns4:italic>IL-1A</ns4:italic> -889C>T, <ns4:italic>TNF-A</ns4:italic> -238G>A, and <ns4:italic>VDR TaqI</ns4:italic> had weak association with HNP susceptibility in both genotypes and allele distributions. However, since heterogeneity was identified among studies included in this meta-analysis, further meta-analysis with a larger population and subgroup analysis on specific population are warranted to support this finding. </ns4:p>
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,005 | 0,013 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,002 | 0,005 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».