MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3165118996 · doi:10.1073/pnas.2104841118

AP-1 is a temporally regulated dual gatekeeper of reprogramming to pluripotency

2021· article· en· W3165118996 sur OpenAlexfundno aff
Glenn J. Markov, Thach Mai, Surag Nair, Anna Shcherbina, Yu Xin Wang, David Burns, Anshul Kundaje, Helen M. Blau

Notice bibliographique

RevueProceedings of the National Academy of Sciences · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Human Genome Research InstituteNational Institute on AgingStanford Bio-XBaxter International FoundationNational Science FoundationGovernment of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchLi Ka Shing Foundation
Mots-clésReprogrammingEmbryonic stem cellCell biologySomatic cellBiologyStem cellRepressorInduced pluripotent stem cellGeneTranscription factorGeneticsMolecular biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Significance Reprogramming of somatic cells holds tremendous therapeutic promise. Here we show that a key barrier to this process is a DNA binding protein named activator protein 1 (AP-1). We find that AP-1 acts sequentially to first maintain the somatic state by turning genes on and then to block the initiation of the new cellular program by acting as a repressor of gene transcription. Crucially, we were able to uncover this feature of AP-1 by using the heterokaryon system of reprogramming, in which human fibroblasts are fused to an excess of mouse embryonic stem cells to favor the induction of the embryonic stem cell program in the fibroblast.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,255

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,316
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueProceedings of the National Academy of SciencesMême sujetPluripotent Stem Cells ResearchTravaux en français237 207