Mutation of a conserved glutamine residue does not abolish desensitization of acid-sensing ion channel 1
Notice bibliographique
Résumé
Desensitization is a common feature of ligand-gated ion channels, although the molecular cause varies widely between channel types. Mutations that greatly reduce or nearly abolish desensitization have been described for many ligand-gated ion channels, including glutamate, GABA, glycine, and nicotinic receptors, but not for acid-sensing ion channels (ASICs) until recently. Mutating Gln276 to a glycine (Q276G) in human ASIC1a was reported to mostly abolish desensitization at both the macroscopic and the single channel levels, potentially providing a valuable tool for subsequent studies. However, we find that in both human and chicken ASIC1, the effect of Q276G is modest. In chicken ASIC1, the equivalent Q277G slightly reduces desensitization when using pH 6.5 as a stimulus but desensitizes, essentially like wild-type, when using more acidic pH values. In addition, steady-state desensitization is intact, albeit right-shifted, and recovery from desensitization is accelerated. Molecular dynamics simulations indicate that the Gln277 side chain participates in a hydrogen bond network that might stabilize the desensitized conformation. Consistent with this, destabilizing this network with the Q277N or Q277L mutations largely mimics the Q277G phenotype. In human ASIC1a, the Q276G mutation also reduces desensitization, but not to the extent reported previously. Interestingly, the kinetic consequences of Q276G depend on the human variant used. In the common G212 variant, Q276G slows desensitization, while in the rare D212 variant desensitization accelerates. Our data reveal that while the Q/G mutation does not abolish or substantially impair desensitization as previously reported, it does point to unexpected differences between chicken and human ASICs and the need for careful scrutiny before using this mutation in future studies.
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Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».