Enregistrement W3166568332 · doi:10.1038/s41586-021-03620-1

A roadmap for the Human Developmental Cell Atlas

2021· article· en· W3166568332 sur OpenAlexaff

Muzlifah Haniffa, Deanne Taylor, Sten Linnarsson, Bruce J. Aronow, Gary D. Bader, Roger A. Barker, Pablo G. Cámara, J. Gray Camp, Alain Chédotal, Andrew J. Copp, Heather Etchevers, Paolo Giacobini, Berthold Göttgens, Guoji Guo, Ania Hupalowska, Kylie R. James, Emily Kirby, Arnold R. Kriegstein, Joakim Lundeberg, John C. Marioni, Kerstin B. Meyer, Kathy K. Niakan, Mats Nilsson, Bayanne Olabi, Dana Pe’er, Aviv Regev, Jennifer Rood, Orit Rozenblatt–Rosen, Sarah A. Teichmann, Barbara Treutlein, Roser Vento‐Tormo, Simone Webb, Pascal Barbry, Omer Ali Bayraktar, Sam Behjati, Andreas Bosio, Bruno Canque, Frédéric Chalmel, Yorick Gitton, Deborah J. Henderson, Anne Jørgensen, Steven Lisgo, Jinyue Liu, Emma Lundberg, Jean‐Léon Maître, Séverine Mazaud‐Guittot, Elizabeth Robertson, Antoine D. Rolland, Raphaël Scharfmann, Michèle Souyri, Erik Sundström, Stéphane Zaffran, Matthias Zilbauer

Notice bibliographique

RevueNature · 2021

Typearticle

Langueen

DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology

ThématiqueSingle-cell and spatial transcriptomics

Établissements canadiensMcGill UniversityUniversity of Toronto

Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeNational Institute of Mental HealthMedical Research CouncilInstitut National de la Santé et de la Recherche MédicaleAgence Nationale de la RechercheUK Research and InnovationWellcome TrustFrancis Crick InstituteCancer Research UK

Mots-clésAtlas (anatomy)Human cellHuman Protein AtlasBiologyOrganogenesisComputational biologyNeuroscienceBioinformaticsGeneticsCell cultureAnatomyGene

DOI10.1038/s41586-021-03620-1

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003

score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004

Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated

Catégories candidatesaucune

Catégories consensuellesaucune

DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune

Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: aucune

GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune

Score de désaccord entre enseignants0,027

Score d'incertitude au seuil0,089

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

Catégorie	Codex	Gemma
Métarecherche	0,003	0,004
Méta-épidémiologie (sens strict)	0,001	0,001
Méta-épidémiologie (sens large)	0,001	0,001
Bibliométrie	0,004	0,005
Études des sciences et des technologies	0,001	0,001
Communication savante	0,003	0,003
Science ouverte	0,002	0,003
Intégrité de la recherche	0,001	0,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)	0,027	0,016

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010

Tête enseignante GPT0,245

Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail

Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel

Domainenon disponible

GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations191

Publié2021

Routes d'admission1

Résumé présentnon

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