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Enregistrement W3166768313 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.883.6

STRUCTURE ‐ FUNCTION ANALYSIS OF THE LIGAND BINDING POCKET OF BITTER TASTE RECEPTOR T2R4

2013· article· en· W3166768313 sur OpenAlexaff
Sai P. Pydi, Ken M. Nelson, Michèle C. Loewen, Rajinder P. Bhullar, Prashen Chelikani

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueBiochemical Analysis and Sensing Techniques
Établissements canadiensPlant Biotechnology InstituteUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryReceptorBitter tasteContext (archaeology)BiochemistryLigand (biochemistry)G protein-coupled receptorStereochemistryAbscisic acidHEK 293 cellsTasteBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Bitter taste receptors (T2Rs) belong to the G protein coupled receptors super family. The 25 human T2Rs are activated by wide range of bitter compounds which includes alkaloids, terpenoids, peptides and amines. The human T2R4 is activated by around 16 bitter agonists, which are mostly sesquiterpene lactones, amine derivatives, purine analogs and aromatic quinolines. From molecular modeling analysis we found that, the plant hormone abscisic acid (ABA), an ABA biosynthetic precursor and few of the ABA metabolites docked with high affinity to T2R4. The ability of these compounds to activate or inactivate T2R4 was analyzed by calcium imaging in a HEK293 cell based assay system. We discuss the results in the context of T2R4 structure and function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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