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Enregistrement W3167407651 · doi:10.1096/fasebj.24.1_supplement.699.4

Hybrid lactoferrins containing transferrin C1 or C2 subdomains bind asialoglycoprotein receptors

2010· article· en· W3167407651 sur OpenAlexaff
Douglas D. McAbee, Sid Seth, Chun‐Ling Jung, Henry Wong, Anthony B. Schryvers

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineNursing
ThématiqueInfant Nutrition and Health
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthResearch Corporation for Science Advancement
Mots-clésAsialoglycoprotein receptorRecombinant DNADissociation constantChemistryTransferrinBiochemistrySf9Surface plasmon resonanceBinding siteReceptorStereochemistryMolecular biologyBiologySpodopteraGeneNanotechnology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Fe‐binding proteins lactoferrin (Lf) and transferrin (Tf) are structurally similar, each Fe‐binding lobe (N, C) composed of two sub‐domains (N1/N2; C1/C2). Lf, but not Tf, binds the major subunit of the asialoglycoprotein receptor (RHL1) in a galactose‐independent manner. To identify C‐lobe regions involved in RHL1 binding, we generated recombinant Lf‐Tf hybrid proteins in which Tf C1 or C2 subdomains were positioned within a Lf background. cDNAs of human Lf and Tf encoding Lf:Tf C1 and Lf:Tf C2 were constructed and expressed in Sf9 insect cells. Binding constants of purified native and recombinant Lfs for RHL1 were determined by surface plasmon resonance. Binding of desialylated ligands and native and recombinant Lf proteins to immobilized RHL1 required Ca 2+ and neutral pH. Tf did not bind RHL1 under any conditions. Average dissociation constants measured for the various proteins were as follows: native Lf: 138 ± 44 nM; r‐Lf: 87 ± 50 nM; Lf:Tf C1 : 31 ± 28 nM; Lf:TfC2: 150 ± 76 nM; and asialofetuin: 21 ± 16 nM. Binding constants for native and recombinant Lfs did not differ statistically. Thus, Tf C1 or C2 sub‐domains in a Lf background showed no loss of RHL1‐binding activity. We conclude that the RHL1 binding determinants on Lf do not reside solely in one of the C‐lobe subdomains. (Support: Research Corporation , NIH DK‐61984).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,290
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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