Hybridization and introgression in sympatric and allopatric populations of four oak species
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Background Hybridization and introgression are vital sources of novel genetic variation driving diversification during reticulated evolution. Quercus is an important model clade, having extraordinary diverse and abundant members in the Northern hemisphere, that are used to studying the introgression of species boundaries and adaptive processes. China is the second-largest distribution center of Quercus , but there are limited studies on introgressive hybridization. Results Here, we screened 17 co-dominant nuclear microsatellite markers to investigate the hybridization and introgression of four oaks ( Quercus acutissima , Quercus variabilis , Quercus fabri , and Quercus serrata ) in 10 populations. We identified 361 alleles in the four-oak species across 17 loci, and all loci were characterized by high genetic variability ( H E = 0.844–0.944) and moderate differentiation ( F ST = 0.037–0.156) levels. A population differentiation analysis revealed the following: allopatric homologous ( F ST = 0.064) < sympatric heterogeneous ( F ST = 0.071) < allopatric heterogeneous ( F ST = 0.084). A Bayesian admixture analysis determined four types of hybrids ( Q. acutissima × Q. variabilis , Q. fabri × Q. serrata , Q. acutissima × Q. fabri , and Q. acutissima × Q. variabilis × Q. fabri ) and their asymmetric introgression. Our results revealed that interspecific hybridization is commonly observed within the section Quercus , with members having tendency to hybridize. Conclusions Our study determined the basic hybridization and introgression states among the studied four oak species and extended our understanding of the evolutionary role of hybridization. The results provide useful theoretical data for formulating conservation strategies.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».