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Enregistrement W3167575597 · doi:10.1186/s12870-021-03007-4

Hybridization and introgression in sympatric and allopatric populations of four oak species

2021· article· en· W3167575597 sur OpenAlexaff
Xuan Li, Gaoming Wei, Yousry A. El‐Kassaby, Yanming Fang

Notice bibliographique

RevueBMC Plant Biology · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesPriority Academic Program Development of Jiangsu Higher Education InstitutionsNational Natural Science Foundation of ChinaNanjing Forestry University
Mots-clésIntrogressionAllopatric speciationBiologySympatric speciationHybridSympatryEvolutionary biologyPopulationZoologyBotanyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Background Hybridization and introgression are vital sources of novel genetic variation driving diversification during reticulated evolution. Quercus is an important model clade, having extraordinary diverse and abundant members in the Northern hemisphere, that are used to studying the introgression of species boundaries and adaptive processes. China is the second-largest distribution center of Quercus , but there are limited studies on introgressive hybridization. Results Here, we screened 17 co-dominant nuclear microsatellite markers to investigate the hybridization and introgression of four oaks ( Quercus acutissima , Quercus variabilis , Quercus fabri , and Quercus serrata ) in 10 populations. We identified 361 alleles in the four-oak species across 17 loci, and all loci were characterized by high genetic variability ( H E = 0.844–0.944) and moderate differentiation ( F ST = 0.037–0.156) levels. A population differentiation analysis revealed the following: allopatric homologous ( F ST = 0.064) < sympatric heterogeneous ( F ST = 0.071) < allopatric heterogeneous ( F ST = 0.084). A Bayesian admixture analysis determined four types of hybrids ( Q. acutissima × Q. variabilis , Q. fabri × Q. serrata , Q. acutissima × Q. fabri , and Q. acutissima × Q. variabilis × Q. fabri ) and their asymmetric introgression. Our results revealed that interspecific hybridization is commonly observed within the section Quercus , with members having tendency to hybridize. Conclusions Our study determined the basic hybridization and introgression states among the studied four oak species and extended our understanding of the evolutionary role of hybridization. The results provide useful theoretical data for formulating conservation strategies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,141
Score d'incertitude au seuil0,230

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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