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Enregistrement W3167765624 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.1102.9

Functional analysis of splice variants of human constitutive androstane receptor: Investigation with flavonol (3‐hydroxyflavone) and its metabolites

2013· article· en· W3167765624 sur OpenAlexafffund
Aik Jiang Lau, Thomas K. H. Chang

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchMichael Smith Health Research BC
Mots-clésGalanginIsorhamnetinMyricetinChemistryPharmacologyTaxifolinQuercetinKaempferolTransactivationConstitutive androstane receptorBiochemistryBiologyTranscription factorGeneNuclear receptorAntioxidant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Constitutive androstane receptor (CAR) controls the transcription of genes involved in diverse biological functions, including bioactivation and detoxification of drugs and toxicants. Naturally occurring splice variants of human CAR (hCAR) exist, including hCAR‐SV23 (insertion of amino acids SPTV), hCAR‐SV24 (APYLT), and hCAR‐SV25 (SPTV and APYLT). In the present study, we investigated the effect of flavonol (3‐hydroxyflavone) and its metabolites (galangin, datiscetin, kaempferol, morin, quercetin, isorhamnetin, tamarixetin, myricetin, and syringetin) on the functionality of hCAR‐SV23, hCAR‐SV24, and hCAR‐SV25. As assessed in a cell‐based reporter gene assay, only flavonol activated hCAR‐SV23 and hCAR‐SV24, whereas none of them activated hCAR‐SV25. Flavonol did not recruit steroid receptor coactivators SRC‐1, SRC‐2, or SRC‐3 to the ligand‐binding domain of hCAR‐SV23 or hCAR‐SV24. By comparison, flavonol, galangin, datiscetin, kaempferol, quercetin, isorhamnetin, and tamarixetin activated hCAR‐WT, but only flavonol recruited coactivators. Thus, addition of OH or OCH 3 substituent at the C2′ or C5′ position of flavonol abolished activation of hCAR‐WT. In summary, flavonol and its metabolites differentially activated hCAR isoforms and, in some cases, this occurred by a mechanism that did not involve coactivator recruitment. [Supported by CIHR and MSFHR]

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,215
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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