Diversity and relationships of<i> Miscanthus sinensis</i> from 20 geographical distributions in China based on SSR markers
Notice bibliographique
Résumé
Miscanthus is a C4 herbaceous perennial genus, and it was chosen as a bioenergy crop due to high biomass yield. Miscanthus sinensis has many phenotypes which are adapted to various environments in China. In this study, 421 accessions of M. sinensis were collected from 22 provinces, and the genetic polymorphisms amongst these germplasm collections were identified using 20 primer pairs designed against 10 each from expressed sequence tag-simple sequence repeats [EST-SSR (eSSR)] and genomic SSR (gSSR) transferable markers from barley. A total of 95 SSR polymorphic bands were detected producing a 100% polymorphic rate among these M. sinensis accessions. The gSSR markers showed a richer genetic polymorphism than eSSR markers. Based on the unweighted pair group method with arithmetic mean (UPGMA) clustering, there was a distinct sub-population separation in M. sinensis, which indicates that geographical differences and natural selection are the driving forces for genetic variation and evolution in the species. The 20 pairs of barley markers matched to 26 polymorphic bands associated with date of heading, plant height, leaf weight, stem weight, leaf/stem ratio, and total biomass yield. Eleven marker polymorphic bands were associated with the date of heading, 4 with plant height, 10 with leaf weight, 7 with stem weight, 3 with leaf/stem ratio, and 10 with biomass yield.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».