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Enregistrement W3168204375 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.75.2

Regulation of early stages in clathrin mediated endocytosis revealed by quantitative analyses in living cells

2013· article· en· W3168204375 sur OpenAlexaff
Sandra L. Schmid, François Aguet, Costin N. Antonescu, Marcel Mettlen, Gaudenz Danuser

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndocytosisClathrinDynaminCell biologyEndocytic cycleVesicleClathrin adaptor proteinsGTPaseReceptor-mediated endocytosisChemistryBiologyCellMembraneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Clathrin‐mediated endocytosis (CME), which occurs at clathrin coated pits (CCPs), requires the major coat proteins, clathrin and AP2 complexes together with a myriad of endocytic accessory factors and lipids. CME proceeds through multiple stages, including initiation, stabilization of nascent CCPs, and maturation during which CCPs collect cargo molecules, grow in size and increasingly invaginate until they remain connected to the cell surface via a narrow neck. The GTPase dynamin assembles onto this neck and drives membrane fission to release clathrin coated vesicles and complete the process. Total internal reflection fluorescence microscopy (TIR‐FM) in living cells expression fluorescently‐tagged coat proteins is a powerful tool to study the assembly, maturation and dynamic behavior of CCPs; however, extracting reliable measurements from these TIR‐FM movies represents a major challenge. We have developed new methods for particle detection and tracking that enable accurate, unbiased and global analyses of CCP dynamics even at low signal:noise. These assays have revealed striking phenotypes resulting from the expression of mutant AP2 adaptors that could not be detected using conventional biochemical assays for CME.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,271
Écart entre enseignants0,248 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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