Regulation of early stages in clathrin mediated endocytosis revealed by quantitative analyses in living cells
Notice bibliographique
Résumé
Clathrin‐mediated endocytosis (CME), which occurs at clathrin coated pits (CCPs), requires the major coat proteins, clathrin and AP2 complexes together with a myriad of endocytic accessory factors and lipids. CME proceeds through multiple stages, including initiation, stabilization of nascent CCPs, and maturation during which CCPs collect cargo molecules, grow in size and increasingly invaginate until they remain connected to the cell surface via a narrow neck. The GTPase dynamin assembles onto this neck and drives membrane fission to release clathrin coated vesicles and complete the process. Total internal reflection fluorescence microscopy (TIR‐FM) in living cells expression fluorescently‐tagged coat proteins is a powerful tool to study the assembly, maturation and dynamic behavior of CCPs; however, extracting reliable measurements from these TIR‐FM movies represents a major challenge. We have developed new methods for particle detection and tracking that enable accurate, unbiased and global analyses of CCP dynamics even at low signal:noise. These assays have revealed striking phenotypes resulting from the expression of mutant AP2 adaptors that could not be detected using conventional biochemical assays for CME.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».