Novel Anaplastic Thyroid Cancer PDXs and Cell Lines: Expanding Preclinical Models of Genetic Diversity
Notice bibliographique
Résumé
CONTEXT: Anaplastic thyroid cancer (ATC) is a rare, aggressive, and deadly disease. Robust preclinical thyroid cancer models are needed to adequately develop and study novel therapeutic agents. Patient-derived xenograft (PDX) models may resemble patient tumors by recapitulating key genetic alterations and gene expression patterns, making them excellent preclinical models for drug response evaluation. OBJECTIVE: We developed distinct ATC PDX models concurrently with cell lines and characterized them in vitro and in vivo. METHODS: Fresh thyroid tumor from patients with a preoperative diagnosis of ATC was surgically collected and divided for concurrent cell line and PDX model development. Cell lines were created by generating single cells through enzymatic digestion. PDX models were developed following direct subcutaneous implantation of fresh tumor on the flank of immune compromised/athymic mice. RESULTS: Six ATC PDX models and 4 cell lines were developed with distinct genetic profiles. Mutational characterization showed one BRAF/TP53/CDKN2A, one BRAF/CDKN2A, one BRAF/TP53, one TP53 only, one TERT-promoter/HRAS, and one TERT-promoter/KRAS/TP53/NF2/NFE2L2 mutated phenotype. Hematoxylin-eosin staining comparing the PDX models to the original patient surgical specimens show remarkable resemblance, while immunohistochemistry stains for important biomarkers were in full concordance (cytokeratin, TTF-1, PAX8, BRAF). Short tandem repeats DNA fingerprinting analysis of all PDX models and cell lines showed strong concordance with the original tumor. PDX successful establishment rate was 32%. CONCLUSION: We have developed and characterized 6 novel ATC PDX models with 4 matching cell lines. Each PDX model harbors a distinct genetic profile, making them excellent tools for preclinical therapeutic trials.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».