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Enregistrement W3169032725 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.973.1

Pch2 is a meiotic hexameric ATPase that binds to and alters Hop1 functions

2013· article· en· W3169032725 sur OpenAlexafffundabout
Cheng Chen, Ahmad Jomaa, Joaquín Ortega, Eric Alani

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of Health
Mots-clésHomologous chromosomeSynaptonemal complexHomologous recombinationMeiosisBiologyGeneticsATP hydrolysisRandom hexamerChromosomeCell biologyGenetic recombinationChromosome segregationDNAATPaseRecombinationMolecular biologyBiochemistryGeneEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

In most organisms, the segregation of chromosomes during the first meiotic division requires at least one crossover between pairs of homologous chromosomes. Crossovers come from programmed double‐strand breaks (DSBs) that are preferentially repaired using the homologous chromosome as a template (this preference is called interhomolog bias). In budding yeast, PCH2 is required to establish proper meiotic chromosome structure, regulate timing of recombination progression and promote interhomolog bias. How Pch2 functions at the molecular level is unknown despite its wide conservation. PCH2 open reading frame contains regions homologous to AAA ATPase proteins, and here we show that: 1. Pch2 is an ATPase that forms a hexamer in the presence of nucleotides. 2. Both ATP binding and hydrolysis by Pch2 are critical for its in vivo functions. 3. Pch2 binds to Hop1, an axial component of the synaptonemal complex, and alters its DNA binding activity. Based on these and previous cell biological observations, we propose that Pch2 acts as a stringency factor in meiosis to facilitate Hop1 binding to specific chromosomal regions, thus licensing steps that monitor recombination progression and lead to interhomolog bias. C.C. and E.A. are supported by NIH GM53085. J.O. is supported by Canadian Institutes of Health Research (MOP‐82930). A.J. is supported by a CIHR Doctoral Research Award.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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