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Enregistrement W3170137356 · doi:10.1002/ajmg.a.62398

Homozygous <scp> <i>WNT9B</i> </scp> variants in two families with bilateral renal agenesis/hypoplasia/dysplasia

2021· article· en· W3170137356 sur OpenAlexafffund
Gabrielle Lemire, Bixia Zheng, Grace U. Ediae, Ruobing Zou, Priya T. Bhola, Caitlin Chisholm, Joseph de Nanassy, Bernard Lo, Chunyan Wang, Shirlee Shril, Sherif El Desoky, Mohammed Shalaby, Jameela A. Kari, Xueqi Wang, Kristin D. Kernohan, Kym M. Boycott, Friedhelm Hildebrandt, Sarah L. Sawyer

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Medical Genetics Part A · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRenal and related cancers
Établissements canadiensNewborn Screening OntarioOttawa HospitalChildren's Hospital of Eastern OntarioUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney DiseasesNational Human Genome Research InstituteGenome CanadaCanadian Institutes of Health ResearchGenome British ColumbiaOntario Genomics Institute
Mots-clésRenal agenesisHypoplasiaProbandRenal dysplasiaAgenesisOligohydramniosDysplasiaMedicineKidney diseaseGenitourinary systemKidneyAnatomyInternal medicineBiologyFetusGeneticsPregnancyMutationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract WNT9B plays a key role in the development of the mammalian urogenital system. It is essential for the induction of mesonephric and metanephric tubules, the regulation of renal tubule morphogenesis, and the regulation of renal progenitor cell expansion and differentiation. To our knowledge, WNT9B has not been associated with renal defects in humans; however, WNT9B −/− mice have renal agenesis/hypoplasia and reproductive tract abnormalities. We report four individuals from two unrelated consanguineous families with bilateral renal agenesis/hypoplasia/dysplasia and homozygous variants in WNT9B . The proband from Family 1 has bilateral renal cystic dysplasia and chronic kidney disease. He has two deceased siblings who presented with bilateral renal hypoplasia/agenesis. The three affected family members were homozygous for a missense variant in WNT9B (NM_003396.2: c.949G>A/p.(Gly317Arg)). The proband from Family 2 has renal hypoplasia/dysplasia, chronic kidney disease, and is homozygous for a nonsense variant in WNT9B (NM_003396.2: c.11dupC/p.(Pro5Alafs*52)). Two of her siblings died in the neonatal period, one confirmed to be in the context of oligohydramnios. The proband's unaffected brother is also homozygous for the nonsense variant in WNT9B , suggesting nonpenetrance. We propose a novel association of WNT9B and renal anomalies in humans. Further study is needed to delineate the contribution of WNT9B to genitourinary anomalies in humans.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: Étude de cas
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,016

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0040,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0030,003
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0030,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0050,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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