MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3170176000 · doi:10.1096/fasebj.2021.35.s1.02626

Proteomic Analysis Suggests Altered Mitochondrial Metabolic Profile in Diabetic Cardiomyopathy

2021· article· en· W3170176000 sur OpenAlexafffund
Karina Pereira Gomes, Luiz G. Almeida, Noura Ballasy, Pariya Edalat, Daniel Young, Antoine Dufour, Vaibhav B. Patel

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdipose Tissue and Metabolism
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésDiabetic cardiomyopathyInternal medicineEndocrinologyHeart failureDownregulation and upregulationCardiomyopathyVentricleProteomicsMedicineDiabetes mellitusProtein subunitBiologyGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Diabetic cardiomyopathy (DCM) occurs independently of coronary artery disease or hypertension, often leading to heart failure and death. Although remarkable progress has been made in recent years, there is still no specific therapy for myocardial damage induced by DCM, mainly due to its unclear molecular basis. To elucidate the molecular mechanisms involved in the DCM progress, we have performed advanced proteomic profiling analysis of heart tissue samples from the membrane‐bound leptin receptor deficient ( db/db ) mice, a widely used murine model of type 2 diabetes. As previously shown by our research group, db/db mice exhibit clinically relevant DCM phenotype by 6 months of age that includes diastolic dysfunction, cardiac hypertrophy, and cardiac fibrosis. Six‐month‐old C57BL/6J‐lepr/lepr ( db/db ) and C57BL/6J (wild type [WT]) male mice were euthanized, and the left ventricle (LV) was appropriately collected and processed for proteomic analysis. By shotgun proteomics performed after dimethyl labelling, we identified 77 differentially expressed proteins in LV of db/db mice. Among these, 27 proteins were downregulated in response to chronic diabetes, while 50 were upregulated. Many of these proteins were associated with energy metabolism, cytoskeleton organization, and calcium handling. The peptide levels of subunits alpha, beta and delta of ATP synthase were upregulated in the LVs of db/db mice. These subunits are arranged to form the F1 domain, a catalytic assembly of the enzyme. We also found a marked induction of cytochrome c1 in db/db mice, which is a catalytic core subunit of the complex III, responsible for electron transfer to cytochrome c. We propose that this may represent an adaptive mechanism by which the diabetic heart attempts to increase electron transfer and thereby enhance mitochondrial ATP production. Conversely, in db/db mice we found a decrease in peptide levels of NADH dehydrogenase 1 beta subcomplex subunit 11, a subunit of complex I that catalyzes transfer of electrons to ubiquinone. In diabetic hearts, we also found a downregulation of atypical kinase COQ8A, an essential lipid‐soluble electron transporter involved in the biosynthesis of ubiquinone. These data suggest that despite attempts by hearts from the diabetic mice to augment mitochondrial ATP production, decreased levels of key components of the electron transport chain may contribute to impaired mitochondrial ATP production. It is likely that ATP synthase subunits and cytochrome c1 may also be downregulated with prolonged persistence of the diabetic phenotype. Our study suggests that diabetic hearts displayed altered expression of mitochondrial metabolic peptides, which may contribute to the progression of DCM in db/db mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,267
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetAdipose Tissue and Metabolism→Travaux en français237 207→