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Enregistrement W3170616394 · doi:10.1038/s41375-021-01314-1

Gene expression-based outcome prediction in advanced stage classical Hodgkin lymphoma treated with BEACOPP

2021· letter· en· W3170616394 sur OpenAlexafffund
Ron D. Jachimowicz, Wolfgang Hiddemann, Gunther Glehr, Horst Müller, Heinz Haverkamp, Christoph Thorns, Martin L. Hansmann, Peter Mӧller, Harald Stein, Thorsten Rehberg, Bastian von Tresckow, Hans Christian Reinhardt, Peter Borchmann, Fong Chun Chan, Rainer Spang, David W. Scott, Andreas Engert, Christian Steidl, Michael Altenbuchinger, Andreas Rosenwald

Notice bibliographique

RevueLeukemia · 2021
Typeletter
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLymphoma Diagnosis and Treatment
Établissements canadiensBC Cancer Agency
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBC Cancer FoundationMax-Planck-GesellschaftMichael Smith Health Research BC
Mots-clésLymphomaClassical Hodgkin lymphomaStage (stratigraphy)OncologyOutcome (game theory)Internal medicineMedicineHodgkin lymphomaGene expressionCancer researchGeneBiologyGeneticsMathematics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Classical Hodgkin Lymphoma (cHL) is a B cell-derived lymphoid malignancy, affecting 2.5-3/100,000 people per year. To date, in patients diagnosed with advanced cHL no reliable tool is able to-a priori-distinguish the subset of patients at high risk for relapse or refractory disease. Clinical risk indices for cHL, such as the International Prognostic Score (IPS), have not been successfully applied as a treatment decision tool in advanced stage cHL In this study we show, that a previously published gene expression-based predictor in advanced stage cHL patients treated with ABVD [2] does not prove prognostic in 401 BEACOPP-treated advanced stage cHL patients. Using transcriptome profiling, we identified however that three individual genes, PDGFRA, TNFRSF8 (encoding CD30) and CCL17 (encoding TARC), were significantly associated with progression-free survival (PFS) after multiple test correction in the BEACOPP-treated cohort, highlighting the potential of a modified gene expression profiling approach for pre-treatment risk assessment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,401
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,260
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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