MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3170617150 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.538.5

Investigation of the pre‐sensor 1 hairpin in minichromosome maintenance proteins 2–7.

2013· article· en· W3170617150 sur OpenAlexaff
Simon K. W. Lam, Tina Lynn Sing, Christopher J. Brandl, Megan J. Davey

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of TorontoWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHelicaseMinichromosome maintenanceMutantCell biologyBiologyWild typeDNADNA replicationChemistryBiochemistryRNAControl of chromosome duplicationGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The minichromosome maintenance proteins 2–7 (Mcm2–7) assemble into the replicative helicase in eukaryotes. To understand how this ring‐shaped helicase translocates along DNA to unwind the duplex nucleic acid, we have analyzed the structure/function relationships of the S. cerevisiae proteins. A pre‐sensor 1 (PS1) hairpin found in archaeal MCMs is thought to be involved in DNA translocation, with a conserved lysine residue predicted to contact the phosphate backbone. We mutated the analogous lysines to alanines in the putative PS1 hairpins of each of the yeast Mcm2–7 subunits. Mutation of the Mcm3 hairpin results in a loss of cellular viability. Its overexpression in the context of a wild‐type allele results in enlarged cells and a reduced growth rate. Purified Mcm2–7 complex containing the Mcm3 hairpin mutant does not unwind DNA in vitro, yet retains wild‐type levels of ATPase activity. Interestingly, individual mutation of the PS1 hairpins of the other subunits does not affect viability. However, these strains do have growth‐related sensitivity to genotoxic stress agents, and cold. Collectively, our data indicates the importance of the PS1 hairpin for Mcm2–7 function. Support from the CIHR

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,203 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetDNA Repair Mechanisms→Travaux en français237 207→