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Enregistrement W3170760961 · doi:10.3233/jhd-200463

Reliable Resolution of Full-Length Huntingtin Alleles by Quantitative Immunoblotting

2021· article· en· W3170760961 sur OpenAlexafffund
Nicholas S. Caron, Hailey Findlay Black, Shaun S. Sanders, Fanny L. Lemarié, Crystal N. Doty, Michael R. Hayden

Notice bibliographique

RevueJournal of Huntington s Disease · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueGenetic Neurodegenerative Diseases
Établissements canadiensPacific Centre for Reproductive MedicineBC Children's HospitalUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésHuntingtinHuntingtin ProteinMutantAlleleBiologyHuntington's diseaseMolecular biologyGeneticsComputational biologyGeneMedicineDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Therapeutics that lower mutant huntingtin (mHTT) have shown promise in preclinical studies and are in clinical development for the treatment of Huntington disease (HD). Multiple assays have been developed that either quantify mHTT or total HTT but may not accurately measure levels of wild type HTT (wtHTT) in biological samples. OBJECTIVE: To optimize a method that can be used to resolve, quantify and directly compare levels of full length wtHTT and mHTT in HD samples. METHODS: We provide a detailed quantitative immunoblotting protocol to reproducibly resolve full length wtHTT and mHTT in multiple HD mouse and patient samples. RESULTS: We show that this assay can be modified, depending on the sample, to resolve wtHTT and mHTT with a wide range of polyglutamine length differences (ΔQs 22-179). We also demonstrate that this method can be used to quantify allele-selective lowering of mHTT using an antisense oligonucleotide in HD patient-derived cells. CONCLUSION: This quantitative immunoblotting method can be used to reliably resolve full-length HTT alleles with ΔQs≥22 and allows for direct comparison of wtHTT and mHTT levels in HD samples.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,009
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,009
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,282
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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