Diverse Intracellular Inclusion Types Within Magnetotactic Bacteria: Implications for Biogeochemical Cycling in Aquatic Environments
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Magnetotactic bacteria (MTB) are a group of prokaryotes that generally live dominantly at or just below the oxic‐anoxic transition zone (OATZ) in diverse aquatic environments. They biomineralize intracellular magnetic nanocrystals of magnetite (Fe 3 O 4 ) or/and greigite (Fe 3 S 4 ) each enveloped by a bilayer membrane, called a magnetosome, and often organized into a chain or chains. Here, we identify a new magnetotactic spirillum strain (tentatively named WYHS‐1) from freshwater sediments of Weiyang Lake, Xi'an, northwestern China, using coupled fluorescence and transmission electron microscopy at the single‐cell level. Phylogenetic analysis of the 16S rRNA gene sequence indicates that strain WYHS‐1 is affiliated with the Azospirillum genus within the Alphaproteobacteria class of the Proteobacteria phylum. Transmission electron microscopy combined with synchrotron‐based scanning transmission X‐ray microscopy analyses reveal that strain WYHS‐1 produces nearly isotropic magnetite‐type crystals, with average lengths and widths of 34.5 ± 6.7 nm and 32.8 ± 6.5 nm, respectively. WYHS‐1 cells also contain at least three other types of intracellular, submicron inclusions: Sulfur (S 0 ) globules, Ca/Mg‐rich polyphosphate granules, and organic‐deficient vacuoles. Unlike magnetic particles, which occur within all WYHS‐1 cells, the latter three inclusion types are not always present, which indicates that they may be temporary intracellular structures that store or transport chemicals. Together with genomic and physicochemical knowledge for available bacteria, we propose a conceptual model in which MTB drive biogeochemical elemental cycling within aquatic OATZ environments and contribute to the distribution and burial of biominerals in sediments.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».