Transcriptome Analysis Reveals Docosahexaenoic Acid and α-Linolenic Acid Affect Cholesterol Metabolism and Migration of Monocytes via Common and Distinct Gene Pathways
Notice bibliographique
Résumé
One of the earliest events in atherosclerotic plaque formation is the migration of monocytes to damaged blood vessels, and the accumulation of cholesterol in monocyte-derived macrophages. The omega-3 fatty acid docosahexaenoic acid (DHA) is known to inhibit this process. While there is limited evidence suggesting α-linolenic acid (ALA) has a similar effect, ALA has not been directly compared to DHA. The primary objective of this study was to compare the gene expression profiles of monocytes that have been exposed to either ALA or DHA and examine the effect of these fatty acids on monocyte cholesterol content and migration in a cell culture model. Transcriptome analysis was performed on total mRNA isolated from human THP-1 monocytes treated with ALA, DHA or vehicle for 48 h. Candidate genes identified via fold change and Ingenuity Pathway Analysis were validated by qPCR. Functional assays to measure total cholesterol content and migration were then performed on monocytes treated with ALA or DHA. Transcriptome analysis identified a series of genes associated with cholesterol metabolism and cell migration altered by ALA and DHA treatment. Changes in mRNA levels for candidate genes were validated by qPCR, with similar expression patterns as in the transcriptome analysis. Based on these data, both fatty acids were predicted to reduce cholesterol synthesis, ALA would increase migration and DHA would have no effect. Functional assays were then performed and revealed that ALA and DHA decreased cholesterol content to a similar extent. Additionally, contrary to our predictions, DHA significantly decreased migration, while ALA had no effect. The results suggest ALA and DHA may influence monocyte migration through distinct gene pathways, while cholesterol metabolism may be regulated by a common mechanism. Furthermore, only DHA treatment reduced monocyte migration in functional assays, while both fatty acids reduced cholesterol content. Due to the critical role of monocyte migration and cholesterol content in the pathophysiology of atherosclerosis, it may be concluded from this study that both DHA and ALA may exert protective effects involving different mechanisms as they relate to individuals at risk for cardiovascular disease. CIHR, NSERC
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».