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Enregistrement W3171188620 · doi:10.1038/s41467-021-23892-5

Hakai is required for stabilization of core components of the m6A mRNA methylation machinery

2021· article· en· W3171188620 sur OpenAlex
Praveen Bawankar, Tina Lenče, Chiara Paolantoni, Irmgard U. Haussmann, Migle Kazlauskiene, Dominik Jacob, Jan B. Heidelberger, Florian Richter, Mohanakarthik P. Nallasivan, Violeta Morı́n, Nastasja Kreim, Petra Beli, Mark Helm, Martin Jínek, Matthias Soller, Jean‐Yves Roignant

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilHakai InstituteSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungDeutsche ForschungsgemeinschaftBoehringer Ingelheim FondsResearch Councils UKLeverhulme TrustNational Science FoundationVallee FoundationAgence Nationale de la RechercheHoward Hughes Medical InstituteEuropean Molecular Biology OrganizationUniversité de LausanneHuman Frontier Science ProgramUniversity of Cambridge
Mots-clésUbiquitin ligaseUbiquitinMethylationMessenger RNAMethyltransferaseCell biologyN6-MethyladenosineFunction (biology)BiologyTranslation (biology)Drosophila (subgenus)ChemistryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract N 6 -methyladenosine (m 6 A) is the most abundant internal modification on mRNA which influences most steps of mRNA metabolism and is involved in several biological functions. The E3 ubiquitin ligase Hakai was previously found in complex with components of the m 6 A methylation machinery in plants and mammalian cells but its precise function remained to be investigated. Here we show that Hakai is a conserved component of the methyltransferase complex in Drosophila and human cells. In Drosophila , its depletion results in reduced m 6 A levels and altered m 6 A-dependent functions including sex determination. We show that its ubiquitination domain is required for dimerization and interaction with other members of the m 6 A machinery, while its catalytic activity is dispensable. Finally, we demonstrate that the loss of Hakai destabilizes several subunits of the methyltransferase complex, resulting in impaired m 6 A deposition. Our work adds functional and molecular insights into the mechanism of the m 6 A mRNA writer complex.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,151
Score d'incertitude au seuil0,205

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,335
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle