Liver microRNAs are differentially expressed in human simple steatosis and non alcoholic steatohepatitis with potential repercussions on lipid metabolism and inflammatory status
Notice bibliographique
Résumé
Non‐alcoholic fatty liver disease is associated with fat deposition in liver. It can present as simple hepatic steatosis (SS) or as non alcoholic steatohepatitis (NASH), which is characterized by inflammation leading to fibrosis. It is unclear which molecular mechanisms differentiate SS and NASH. Progression of SS to NASH is associated with altered hepatic microRNA (miRNA) expression in animal models, but human data are scarce. We analyzed the miRNA expression signature in histology‐proven healthy (H; n= 24), SS (n= 24) or NASH (n= 23) human adult livers by NanoString technology. We found that samples from the 3 groups cluster by disease state based on 142 differentially expressed miRNAs, suggesting that a specific liver miRNA signature distinguishes H, SS and NASH. Putative gene targets of these miRNAs were identified with 12 algorithms and used for gene ontology enrichment analysis. This showed that processes including gene transcription, apoptosis and the TGF‐β signaling pathway are commonly altered between H, SS and NASH. In addition, NASH was associated with altered regulation of lipid storage, IL‐6 and adipocytokine signaling pathways as compared to H and SS and regulation of cholesterol storage as compared to SS. These differences may have therapeutic potential. Funding sources: American College of Gastroenterology, Canadian Institutes of Health Research
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».