The 26S proteasome binds and degrades Pih1 via the C‐terminal degron elements in yeast <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
In yeast Saccharomyces cerevisiae , R2TP complex is required for the box C/D small nucleolar ribonucleoprotein (snoRNP) assembly and ribosomal RNA processing. This complex is composed of Rvb1 and Rvb2, two ATP‐dependent DNA helicases, Tah1, an Hsp90 cofactor, and Pih1, a subunit that acts as a scaffold and likely regulates the Rvb1/Rvb2 helicase activities. We have previously shown that Rvb1 and Rvb2 bind to the N‐terminal fragment of Pih1, while Tah1 binds to the Pih1 C‐terminal fragment. Additionally, the C‐terminus of Pih1 acts as a degron that regulates Pih1 degradation in vivo and controls R2TP complex assembly. To understand the mechanism of Pih1 degradation in vivo, we purified Pih1 protein complex from yeast cells and immunoblotting analysis indicated that Pih1 is able to pull down some 26S proteasome subunits. In vitro binding assays indicated that Pih1 C‐terminal degron elements are likely to interact with 26S proteasome directly. Based on in vitro and in vivo degradation assay, we propose a model of proteasome dependent, but ubiquitin independent degradation of Pih1 in yeast cells. (This work is supported by a Connaught New Staff Matching Fund and an NSERC Discovery Grant to RZ)
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».