Exploring the genetic variability of citrus butterfly (Papilio demoleus) using DNA barcode
Notice bibliographique
Résumé
The present study is first and initial report from India on developing barcodes and molecular identification of citrus swallow tail butterfly (Papilio demoleus L.) based on mtCOI region and species composition from Abohar, Jalandhar, Ludhiana, Sangrur areas of Punjab on citrus host plants. The corresponding genomic DNA isolation, PCR amplification, detectable genetic divergence, molecular identification and phylogenetic tree were assessed. Using the specific set of primers the samples yielded specific fragment of 658 bp. The amplified PCR product was sequenced and identified as Papilio demoleus and submitted to BOLD database. The 658 bp mtCOI gene sequences from Abohar, Ludhiana, Jalandhar were 100% similar however the sequence from Sangrur region show mutations at three different positions showing a variation of 0.45% from rest of the populations of Punjab. The phylogenetic tree was developed and it was revealed that all the populations of Punjab are in same cluster and when compared with populations from other countries, it form two main clusters which are different from each other by 3.70%. The cluster one includes all the populations of Australia, India, USA and Pakistan and the cluster two include totally different populations from Canada. In cluster one the populations from Australia and USA forms one subgroup while populations from India and Pakistan form second subgroup.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».