The Mechanism of Quorum Sensing Inhibition in <i>Streptococcus pyogenes</i> by the Phage Protein Paratox
Notice bibliographique
Résumé
Streptococcus pyogenes is a causative agent of pharyngitis and necrotizing fasciitis. Key to its pathogenicity are numerous prophages spread throughout its genome that encode deadly toxins. These prophages also encode several proteins whose biological function is unknown. Of particular interest is the conserved phage protein paratox (Prx), which is genetically linked to phage toxin genes. Our past results have shown that Prx expression is regulated by the natural competence ComRS quorum sensing pathway, and that Prx itself is a negative regulator of ComRS. Prx directly binds the transcription factor and quorum sensing receptor ComR and inhibits its ability to bind DNA by an unknown mechanism. As ComR undergoes a significant conformational change upon binding the peptide pheromone XIP, we hypothesize that Prx employs a novel mechanism of protein‐protein binding and inhibition. Using a combination of structural biology and biochemistry, including X‐ray crystallography, small‐angle X‐ray scattering (SAXS), and various fluorescence assays, we have been able to elucidate the molecular details of how Prx manipulates the conformation of ComR to prevent activation by the XIP pheromone. Our results not only reveal a dynamic protein‐protein binding mechanism, but further demonstrate the myriad roles that phage proteins have evolved to regulate the pathways of their hosts for self‐preservation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».