MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W3172709843 · doi:10.1096/fasebj.27.1_supplement.914.6

Modulation of αENaC mRNA expression under different stresses: Implication of its 3′UTR.

2013· article· en· W3172709843 sur OpenAlexfundno aff
Francis Migneault, Mihai Pascariu, André Dagenais, Yves Berthiaume

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon Transport and Channel Regulation
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCommon Fund for Commodities
Mots-clésEpithelial sodium channelMessenger RNAMolecular biologyUntranslated regionCycloheximideChemistryTransfectionTranscription (linguistics)BiologyProtein biosynthesisCell biologyGeneSodiumBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Active sodium transport by the epithelial Na+ channel (ENaC) is important for fluid movement across the alveolar epithelium in the lungs and for the resolution of pulmonary oedema in acute respiratory distress syndrome (ARDS). It was shown that cellular stress induced by lipopolysaccharides (LPS) or cycloheximide (Chx) downregulate αENaC mRNA via different molecular mechanisms. The purpose of this project was to investigate the importance of the αENaC 3′UTR in the mRNA modulation of ENaC. Alveolar epithelial cells were co‐transfected with 3′UTR mutants (V5/ENaC±3′UTR and Luc±3′UTR) inserted in pTRE‐tight vector along with the Tet‐Off vector. The cells were treated with Chx (1.0μM), LPS (15μg/mL) or Actinomycin D (5μg/mL) along with Dox (1μg/mL) to inhibit transcription. We found that 3′UTR deletion caused a ~60% decrease of luciferase activity and expression compared to the complete recombinant. The T 1/2 of V5‐αENaC mRNA was 60 min and the deletion of 3′UTR reduced T 1/2 to 37min. Chx reduced αENaC mRNA T 1/2 to 33min whereas LPS had no effect. Actinomycin D, a transcription inhibitor, increased T 1/2 >; 120min. These results suggest that the αENaC mRNA half‐life is shorter then previously estimated and that 3′UTR seems to be important for the stability of αENaC mRNA. Supported by FRSQ, CFC and CIHR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,107
Score d'incertitude au seuil0,181

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB JournalMême sujetIon Transport and Channel RegulationTravaux en français237 207