An isoform of actin is associated with the cancer status of ovarian and breast epithelial cells
Notice bibliographique
Résumé
An isoform of actin associated with non‐malignant ovarian and breast epithelial cells was detected in a study investigating cancer specific forms of PCNA (proliferating cell nuclear antigen) in ovarian and breast cancer materials. An antibody (B1 antibody) generated against ten residues from the interdomain connector loop in PCNA, detected not only PCNA, but a novel protein in non‐malignant cells. Immunoprecipitation was performed using the B1 antibody and proteins were cut from gels. In‐gel trypsin digestion was performed for MALDI‐TOF analysis. The novel protein was identified as a form of actin using Mascot peptide fingerprinting software. Immunoblotting with actin antibodies support the identification of the B1 protein as an isoform of actin. A local alignment between PCNA and beta‐actin was performed and found a ten‐residue area of overlap with 50% homology between PCNA and beta‐actin which corresponded to the antigen for the B1 antibody. This homology is likely the basis of the cross reaction with beta‐actin. To avoid the cross reaction with PCNA exhibited by the B1 antibody, a second antibody (ACTB358) was generated to 11 residues starting at residue 358 of beta actin The ACTB358 antibody is highly specific for a novel isoform of actin with a mass of 86 kDa and a pI of 5.5, but does not interact with cytoplasmic or other types of actin. We are investigating the sequence and expression of the novel isoform of actin in non‐malignant and malignant ovarian and breast cells. Support by NOSMFA Research Development Fund
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».