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Enregistrement W3173492544 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.686.2

Hydrogen‐Deuterium exchange reveals distinct activation states of PLCβ2 by G‐proteins

2018· article· en· W3173492544 sur OpenAlexaff
Isaac J. Fisher, Meredith L. Jenkins, Gregory G. Tall, John E. Burke, Alan V. Smrcka

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésPhospholipase CGq alpha subunitChemistryDiacylglycerol kinaseG proteinPleckstrin homology domainPhosphatidylinositolG protein-coupled receptorHydrogen–deuterium exchangeReceptorStereochemistryBiochemistrySignal transductionProtein kinase C

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

G‐protein coupled receptors (GPCRs) are an important class of cell surface receptors that transduce extracellular stimuli to intracellular signaling events via G‐proteins. One major effector of G proteins is phospholipase C (PLC), which hydrolyzes Phosphatidylinositol 4,5 bisphosphate (PIP 2 ) into Diacylglycerol (DAG) and Inositol 1,4,5, trisphosphate (IP 3 ). PLCβ2 and PLCβ3 isoforms are directly activated by binding Gα q , Gβγ or both. The mechanism of activation of PLCβ2 by Gβγ is unknown, and the binding site(s) for Gβγ on PLCβ remain controversial. Here, we use hydrogen‐deuterium exchange mass spectrometry (HDXMS) to understand the conformational dynamics of PLCβ and to answer open questions in the field concerning the mechanism of activation of PLC by Gβγ and Gα q . For these experiments, several complexes were examined with HDXMS: PLCβ2 alone, PLCβ2+ PIP 2 /Phosphoethanolamine (PE)/Phosphatidylserine (PS) vesicles, or PLCβ2+ PIP 2 /PE/PS vesicles plus Gβγ or Gα q ‐AlF 4 . Incubation of PLCβ2 with PIP 2 /PE/PS vesicles strongly protects regions in the C‐terminus, confirming that this region is involved in membrane binding. In the presence of Gα q ‐AlF 4 , PLCβ2 shows protection from deuterium exchange in the helix‐loop‐helix region of the proximal C‐terminal domain (CTD) and the EF‐hand domain on PLCβ2 that exactly correspond to regions shown to interact with Gα q in the Gα q ‐PLCβ3 crystal structure. These data validate that our approach accurately reports bona fide protein‐protein and protein‐lipid interactions. Incubation of Gβγ with PLCβ2 does not reveal any regions of strong protection, but rather causes strong increases in deuterium exchange in the of the CTD of PLCβ2, indicating that the CTD of PLC undergoes a large conformational rearrangement upon Gβγ binding. This increase in deuterium exchange of the CTD of PLC is not seen upon Gα q activation. This indicates that there are distinct conformational states of PLCβ induced by Gα q and Gβγ interactions, suggesting that Gα q and Gβγ use different mechanisms for activation of PLCβ. Finally, these data suggest a mechanism for activation of PLC by Gβγ, where Gβγ binding to PLC breaks an autoinhibitory interaction involving the CTD of PLC and either the membrane or another portion of PLCβ2. Support or Funding Information This work is supported by NIH R01 GM081772 to AVS. This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,017
Score d'incertitude au seuil0,292

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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