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Enregistrement W3173556047 · doi:10.21105/joss.03262

DataLad: distributed system for joint management of code, data, and their relationship

2021· article· en· W3173556047 sur OpenAlexaff
Yaroslav O. Halchenko, Kyle Meyer, Benjamin Poldrack, Debanjum S. Solanky, Adina Wagner, Jason Gors, D.R. MacFarlane, Dorian Pustina, Vanessa Sochat, Satrajit Ghosh, Christian Mönch, Christopher J. Markiewicz, Laura K. Waite, Ilya Shlyakhter, Alejandro de la Vega, Soichi Hayashi, Christian Olaf Häusler, Jean‐Baptiste Poline, Tobias Kadelka, Kusti Skytén, Dorota Jarecka, David N. Kennedy, Ted Strauss, Matt Cieslak, Peter Vavra, Horea-Ioan Ioanas, Robin Schneider, Mika Pflüger, James V. Haxby, Simon B. Eickhoff, Michael Hanke

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Open Source Software · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueScientific Computing and Data Management
Établissements canadiensMontreal Neurological Institute and HospitalMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Mental HealthBundesministerium für Bildung und ForschungNational Science Foundation
Mots-clésComputer sciencePython (programming language)InteroperabilityData managementPersistent data structureSoftware engineeringData sharingDistributed computingDatabaseWorld Wide WebOperating system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

DataLad is a Python-based tool for the joint management of code, data, and their relationship, built on top of a versatile system for data logistics (git-annex) and the most popular distributed version control system (Git). It adapts principles of open-source software development and distribution to address the technical challenges of data management, data sharing, and digital provenance collection across the life cycle of digital objects. DataLad aims to make data management as easy as managing code. It streamlines procedures to consume, publish, and update data, for data of any size or type, and to link them as precisely versioned, lightweight dependencies. DataLad helps to make science more reproducible and FAIR (Wilkinson et al., 2016). It can capture complete and actionable process provenance of data transformations to enable automatic re-computation. The DataLad project (datalad.org) delivers a completely open, pioneering platform for flexible decentralized research data management (RDM) (Hanke, Pestilli, et al., 2021). It features a Python and a command-line interface, an extensible architecture, and does not depend on any centralized services but facilitates interoperability with a plurality of existing tools and services. In order to maximize its utility and target audience, DataLad is available for all major operating systems, and can be integrated into established workflows and environments with minimal friction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,011
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesScience ouverte
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Logiciel · Signal consensuel: Logiciel
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,094

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0110,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0040,003
Études des sciences et des technologies0,0020,003
Communication savante0,0070,013
Science ouverte0,0060,021
Intégrité de la recherche0,0020,006
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0280,027

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,266
Tête enseignante GPT0,397
Écart entre enseignants0,130 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreLogiciel

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations158
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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