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Enregistrement W3173593446 · doi:10.1101/2021.06.28.450088

A novel small molecule that induces cytotoxicity in lung cancer cells inhibits disulfide reductases GSR and TXNRD1

2021· preprint· en· W3173593446 sur OpenAlexafffund
Fraser Johnson, John R. Ferrarone, Alvin Liu, Christina Brandstädter, Ravi S. N. Munuganti, Dylan Farnsworth, Daniel Lu, Jennifer Luu, Tianna S. Sihota, Sophie Jansen, Amy Nagelberg, Rocky Shi, Giovanni C. Forcina, Xu Zhang, Grace Cheng, Sandra E. Spencer Miko, Georgia de Rappard-Yuswack, Poul H. Sorensen, Scott J. Dixon, Udayan Guha, Katja Becker, Hakim Djaballah, Romel Somwar, Harold Varmus, Gregg B. Morin, William W. Lockwood

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2021
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRedox biology and oxidative stress
Établissements canadiensCanada's Michael Smith Genome Sciences CentreUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesBC Cancer FoundationTerry Fox Research InstituteCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésThioredoxin reductaseSynthetic lethalitySmall moleculeThioredoxinGlutathioneCell biologyCell cultureCytotoxicityReactive oxygen speciesChemistryCell signalingProteomeBiologyOxidative stressCancer researchBiochemistryMutantSignal transductionEnzymeIn vitroGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract High-throughput phenotype-based screening of large libraries of novel compounds without known targets can identify small molecules that elicit a desired cellular response, but additional approaches are required to find and characterize their targets and mechanisms of action. Here we show that a compound termed lung cancer screen 3 (LCS3), previously selected for its ability to impair the growth of human lung adenocarcinoma (LUAD) cell lines, but not normal lung cells, induces oxidative stress and activates the NRF2 signaling pathway by generating reactive oxygen species (ROS) in sensitive LUAD cell lines. To identify the target that mediates this effect, we applied thermal proteome profiling (TPP) and uncovered the disulfide reductases GSR and TXNRD1 as LCS3 targets. Through enzymatic assays using purified protein, we confirmed that LCS3 inhibits disulfide reductase activity through a reversible, uncompetitive mechanism. Further, we demonstrate that LCS3-sensitive LUAD cells are correspondingly sensitive to the synergistic inhibition of glutathione and thioredoxin pathways. Lastly, a genome-wide CRISPR knockout screen identified the loss of NQO1 as a mechanism of LCS3 resistance. This work highlights the ability of TPP to uncover targets of small molecules identified by high-throughput screens and demonstrates the potential utility of inhibiting disulfide reductases as a therapeutic strategy for LUAD.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2021
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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