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Enregistrement W3173604864 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.522.2

Edwardsiella tarda Alter Their Protein Expression Profiles at Permissive Human Temperatures and Control the Host Cytoskeleton for their Benefit

2012· article· en· W3173604864 sur OpenAlexaffabout
Byron Joel Tenkink, Rebecca J. Noort, Bupe A. Siame, Julian A. Guttman, Ka Yin Leung

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueParasite Biology and Host Interactions
Établissements canadiensTrinity Western UniversityWestern UniversitySimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEdwardsiella tardaEffectorSecretionBiologyPathogenesisPathogenCytoskeletonCell biologyMicrobiologyImmunologyCellGeneGeneticsBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Edwardsiella tarda is an emerging enteric pathogen that infects both warm‐water fish and humans. While it is known that E. tarda utilizes syringe‐like type III and type VI secretion systems to deliver effector proteins into fish host cells during infection, little is known about E. tarda pathogenesis in humans at the sub‐cellular level. To investigate the pathogenic strategies employed by E. tarda we tested two hypotheses; (1) E. tarda alter the expression of secreted proteins at 37°C and (2) E. tarda hijack the host cytoskeletal system in human cells as part of their pathogenesis. To test these hypotheses we grew E. tarda at 30°C and at 37°C and compared type III and type VI secretion system protein expression profiles at the two temperatures. Some strains of E. tarda produced more secreted proteins at 37°C than at 30°C, which suggests greater activity from the pathogen's secretion systems at human body temperature. When E. tarda infections in HeLa cells were examined microscopically, we found cytoskeletal and organellar alterations in infected cells as compared to uninfected controls, demonstrating effector‐driven sub‐cellular alterations. Taken together our results indicate that E. tarda hone their protein expression machinery to their environment and control crucial aspects of their host cells during their infectious processes. Grant Funding Source : Natural Science and Engineering Research Council of Canada

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,283
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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