MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W3173627605 · doi:10.1096/fasebj.22.1_supplement.1157.3

Caloxin 1c2: Experimental Evidence That It Binds Plasma Membrane Calcium Pump

2008· article· en· W3173627605 sur OpenAlexaffabout
Jyoti Pande, Magdalena M. Szewczyk, R. Kuner, Paromita Ghosh, Ashok K. Grover

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiotinylationStreptavidinChemistryExtracellularBiotinMembraneBiochemistryBiophysicsMolecular biologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We engineered caloxin 1c2, a novel high affinity peptide (TAWSEVLDLLRRGGGSK‐amide) inhibitor of the Plasma Membrane Ca 2+ pump (PMCA). To show that caloxin 1c2 acts by binding to the PMCA, we synthesized a photoreactive derivative 3Bpa‐caloxin 1c2 (TA(Bpa)SEVLDLLRRGGGSK‐biotin), containing the photoreactive residue Bpa (benzoylphenylalanine) and biotin. 3Bpa‐caloxin 1c2 inhibited the Ca 2+ ‐Mg 2+ ‐ATPase activity of PMCA. The human erythrocyte membranes were photolabeled with 3Bpa‐caloxin 1c2 and the proteins were detected in the Western blots using HRP‐streptavidin to identify biotin or PMCA antibodies to detect PMCA. The photolabeled erythrocyte membranes showed a 250–270 kDa doublet with HRP‐streptavidin. The degree of biotinylation of the erythrocyte membranes depended on the length of the cross‐linking time, and concentrations of 3Bpa‐caloxin 1c2 and the membrane protein. Immunoprecipitates from the photolabeled erythrocyte membranes using a PMCA antibody showed a 250–270 kDa doublet with HRP‐streptavidin. Biotinylated proteins isolated from the photolabeled erythrocyte membranes using captavidin also showed a 250–270 kDa doublet with HRP‐streptavidin and PMCA antibodies. Caloxin 1c2 had been selected for binding to the extracellular domain 1 (amino acids 115–131) of PMCA isoform 4. Caloxin 1c2 and the extracellular domain 1 peptide of PMCA 4 competed with 3Bpa‐caloxin 1c2 for photolabeling the erythrocyte membranes. Pieces of de‐endothelialized pig coronary artery cross‐linked to 3Bpa‐caloxin 1c2 and treated with Alexa‐streptavidin were examined by confocal microscopy, using the Na + ‐pump inhibitor Bodipy‐ouabain as a positive control. Both the probes bound to the cell surface. Thus, the photoreactive derivative of caloxin 1c2 binds to PMCA at the cell surface. Supported by Heart & Stroke Foundation of Ontario.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,064
Tête enseignante GPT0,286
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe FASEB Journal→Même sujetReceptor Mechanisms and Signaling→Travaux en français237 207→