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Enregistrement W3174254508 · doi:10.1096/fasebj.20.4.a42-b

Stochastic high‐speed rotation of <i>Escherichia coli</i> ATP synthase F <sub>1</sub> sector: the ε subunit‐sensitive rotation

2006· article· en· W3174254508 sur OpenAlexaff
Mayumi Nakanishi‐Matsui, Sachiko Kashiwagi, Hiroyuki Hosokawa, Daniel J. Cipriano, Stanley D. Dunn, Yoh Wada, Masamitsu Futai

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueATP Synthase and ATPases Research
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésATP synthaseATPaseATP hydrolysisProtein subunitAllosteric regulationChemistryRandom hexamerRotation (mathematics)F-ATPaseKineticsEnzymeSteady state (chemistry)BiophysicsMoleculeCrystallographyStereochemistryBiochemistryBiologyPhysicsPhysical chemistryOrganic chemistryMathematicsGeometry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The γ subunit of the ATP synthase F 1 sector rotates at the center of the α 3 β 3 hexamer during ATP hydrolysis. A gold bead (40 ~ 200 nm diameter) was attached to the γ subunit of E. coli F 1 , and then its ATP hydrolysis‐dependent rotation was studied. The rotation speeds were variable, showing stochastic fluctuation. The high‐speed rates of 40 nm and 60 nm beads were essentially similar: 721 and 671 rps (revolutions/second), respectively. The average rate of 60 nm beads was 381 rps, which is ~ 13‐fold faster than that expected from the steady‐state ATPase turnover number. These results indicate that the F 1 sector rotates much faster than expected from bulk ATPase activity, and that ~ 10 % of F 1 molecules are active on the m sec time scale. Furthermore, the real ATP turnover number (number of ATP molecules converted to ADP and phosphate per sec), as a single molecule, is variable during a short period. The ε subunit inhibited rotation and ATPase whereas ε fused through its carboxyl‐terminus to cytochrome b 562 showed no effect. The ε significantly increased the pausing time during the rotation. Stochastic fluctuation of the catalysis may be a general property of an enzymes, although its understanding requires combining studies of steady‐state kinetics and single molecule observation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,013
Score d'incertitude au seuil0,435

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2006
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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