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Enregistrement W3174330709 · doi:10.1096/fasebj.2019.33.1_supplement.502.5

Identification and Characterization of UBE2O as a New β‐arrestin Interactor

2019· article· en· W3174330709 sur OpenAlexaff
Badr Sokrat, Michel Bouvier

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2019
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueReceptor Mechanisms and Signaling
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésArrestinCell biologyUbiquitin ligaseInteractomeUbiquitinBiotinylationBiologyProximity ligation assayProtein–protein interactionScaffold proteinG protein-coupled receptorSignal transductionImmunoprecipitationMolecular biologyBiochemistryReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

β‐arrestin plays a major role in GPCR regulation and can act as a scaffolding protein for activation of non‐canonical signaling pathways. Thus, it is important to improve our knowledge of β‐arrestin interactors and the role of these protein complexes in GPCR regulation and signaling. The goal of this project was to identify new β‐arrestin interaction partners using the BioID proteomic approach. The BioID technique consists in the fusion of the biotin ligase protein BirA to β‐arrestin and exploits BirA capacity to biotinylate proteins in its proximity. The biotinylated proteins can then be isolated using streptavidin beads and identified by mass spectrometry. We identified 37 potential interactors for β‐arrestin 1 and 86 potential interactors for β‐arrestin 2 localized in different cellular compartments and involved in many different cellular functions and signaling pathways. One of the potential interactors identified is the atypical ubiquitin ligase UBE2O, which caught our attention due to the importance of ubiquitination in β‐arrestin and GPCR regulation. We confirmed the interaction between β‐arrestin 2 and UBE2O by co‐immunoprecipitation. UBE2O is known for its role in the monoubiquitination of BAP1, a tumor suppressor protein that interacts with chromatin‐associated proteins and regulates cell proliferation, resulting in its cytoplasmic sequestration. However, UBE2O function in β‐arrestin and GPCR signaling remains unknown. Considering that β‐arrestin shuttles between the cytoplasm and nucleus, UBE2O could play a role in the regulation of its cellular localization. Using different proteomic and biochemical approaches, we explored the function of UBE2O in GPCR and β‐arrestin ubiquitination and its potential effects on GPCR signaling and trafficking. We were able to identify by mass spectrometry UBE2O substrates involved in GPCR signaling and we showed that UBE2O affects β‐arrestin and GPCR trafficking by ebBRET (Enhanced bystander bioluminescence resonance energy transfer). Considering GPCRs physiological and therapeutic importance, this project will allow improvement of our understanding and knowledge on ubiquitination regulation of GPCR signaling and could contribute to revealing new signaling modalities that might have therapeutic relevance. This abstract is from the Experimental Biology 2019 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,224 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2019
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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