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Enregistrement W3174359129 · doi:10.1016/j.molstruc.2021.130998

Experimental and computational structural studies of 5-substituted-3-(1-arylmethyl-1,2,3,6-tetrahydropyridin-4-yl)-1H-indoles

2021· article· en· W3174359129 sur OpenAlexfundno aff
Agata Bartyzel, Magda Kondej, Piotr Stępnicki, Tomasz M. Wróbel, Agnieszka A. Kaczor

Notice bibliographique

RevueJournal of Molecular Structure · 2021
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueSynthesis and Reactivity of Heterocycles
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitut de Cardiologie de MontréalChina Scholarship CouncilNarodowe Centrum Nauki
Mots-clésChemistryMoietyDihedral angleHydrogen bondCrystal structureMoleculeIndole testCrystallographyStereochemistryIntermolecular forceSupramolecular chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Four compounds ( 1–4 ) reported in our previous work as potential antipsychotics with affinity for dopamine D 2 and serotonin 5-HT 1A and 5-HT 2A receptors, were now subjected to detailed structural characterization. The X-ray analysis conducted for studied compounds proved that interatomic distances and bond angles in their crystal structures lie within normal values. The indole group in all compounds is planar, whereas tetrahydropyridine moiety exhibits almost ideal or close to half-chair conformation and is slightly or significantly rotated in relation to the indole group plane by 9.49(1)°, 30.24(11)°, 7.43(6)° and 15.98(18)° in compounds 1–4, respectively. The R 1 substituents of tetrahydropyridine group in all cases form a dihedral angle with the indole moiety with value ranging from 66.57(14)° ( 2 ) to 86.73(17)° ( 4 ). The crystal structure of 1 is stabilized by N–H···N hydrogen bonds and C–H···π interactions. The intermolecular C(12)−H(12B)··· Cg (2) interactions form a supramolecular two-dimensional network. The molecules in the crystal of 2 are linked by N–H···N. The formed chains are additionally stabilized with C–H···S hydrogen bonds. In case of compound 3 , molecule chains are formed by N–H···N hydrogen bonds and are further linked via C–H···O hydrogen bonds into layer. The crystal structure is also stabilized by intermolecular C–H···π interactions. The molecules of compound 4 are linked by N–H···N hydrogen bonds and further stabilized by intermolecular C–H···π interactions. Crystallographic analysis was complemented with computational studies, such as Frontier Molecular Orbital analysis, which indicated that all four compounds display similar chemical reactivity, regardless of different R 1 and R 2 substituents. In addition, the most reactive parts of the compounds appear to be the indole and double bond located in tetrahydropyridine moiety. Lastly, the calculations of electrostatic potential and non-covalent interactions have been performed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,029

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0090,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,284
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2021
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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