Role of the GRK2 extreme amino terminus and active site tether in forming G protein‐coupled receptor docking site
Notice bibliographique
Résumé
G protein‐coupled receptor (GPCR) kinases (GRKs) phosphorylate agonist‐activated GPCRs to initiate receptor desensitization, but the mechanism of kinase domain activation is unclear. Because agonist‐activated receptors dramatically stimulate the catalytic activity of GRKs, we sought to identify GRK2 residues located outside the active site that play a role in receptor interaction. Previous work suggested that active site tether (AST) residues of the kinase carboxyl‐tail extension are required for GRK activation, and that N‐terminal helix and AST interaction is important for receptor phosphorylation. We therefore carried out systematic mutagenesis of residues 3–18 and the AST of GRK2, and characterized these mutants using in vitro rhodopsin and peptide phosphorylation, GRK activation, intact cell β 2 ‐adrenergic receptor phosphorylation, and cell based α 2 ‐adrenergic receptor recruitment assays. Our results suggest that the N‐terminus and AST, both intrinsically disordered in the inactive kinase, play important roles in formation of the interaction site with activated receptors. Funding: NSF (RSM), NIH (JT), Canadian Institute for Health Research (MB), and FRSQ & Groupe de Recherche Universitaire sur le Médicament (AB).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».