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Enregistrement W3174407408 · doi:10.1096/fasebj.25.1_supplement.905.2

The gene TDAG51 facilitates the phosphorylation of eIF2α in mouse embryonic fibroblasts

2011· article· en· W3174407408 sur OpenAlexafffund
Rachel E. Carlisle, Jeffrey G. Dickhout, Richard C. Austin

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEndoplasmic Reticulum Stress and Disease
Établissements canadiensMcMaster UniversitySt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésUnfolded protein responsePhosphorylationDephosphorylationTunicamycinEndoplasmic reticulumCell biologyGene knockdownIntegrated stress responseCHOPChemistryBiologyMolecular biologyTranslation (biology)PhosphataseMessenger RNABiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Unfolded protein accumulation in the endoplasmic reticulum (ER) results in ER stress. This causes the binding of GRP78 to unfolded proteins, auto‐phosphorylation of PERK and the phosphorylation of eIF2α, leading to changes in the rate and characteristics of protein synthesis, including an upregulation of CHOP/GADD153 expression. TDAG51 is an ER stress response gene and has been shown to regulate translation. We hypothesized that TDAG51 influences protein translation by mediating the phosphorylation of eIF2α. Mouse embryonic fibroblasts (MEFs) treated with ER stressors, tunicamycin (Tm; 5 μg/ml) or thapsigargin (Tg; 1 μM), or a phosphorylated eIF2α dephosphorylation inhibitor, salubrinal (30 μM), or combined treatments demonstrated an increase in eIF2α phosphorylation. TDAG51 −/− MEFs showed a decrease in eIF2α phosphorylation to drug vehicle, Tm plus salubrinal, Tg and Tg plus salubrinal treatment. It was determined that TDAG51 −/− MEFs have reduced CHOP/GADD153 expression compared to wild type cells. Therefore, TDAG51 knockout may regulate CHOP/GADD153 expression by reducing the phosphorylation of eIF2α, which in turn may lead to decreased expression of GADD34, essentially inhibiting the GADD34/PP1 dephosphorylation complex. This mechanism is also being investigated through the use of siRNA‐mediated knockdown. Supported by CIHR MOP‐67116.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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