The gene TDAG51 facilitates the phosphorylation of eIF2α in mouse embryonic fibroblasts
Notice bibliographique
Résumé
Unfolded protein accumulation in the endoplasmic reticulum (ER) results in ER stress. This causes the binding of GRP78 to unfolded proteins, auto‐phosphorylation of PERK and the phosphorylation of eIF2α, leading to changes in the rate and characteristics of protein synthesis, including an upregulation of CHOP/GADD153 expression. TDAG51 is an ER stress response gene and has been shown to regulate translation. We hypothesized that TDAG51 influences protein translation by mediating the phosphorylation of eIF2α. Mouse embryonic fibroblasts (MEFs) treated with ER stressors, tunicamycin (Tm; 5 μg/ml) or thapsigargin (Tg; 1 μM), or a phosphorylated eIF2α dephosphorylation inhibitor, salubrinal (30 μM), or combined treatments demonstrated an increase in eIF2α phosphorylation. TDAG51 −/− MEFs showed a decrease in eIF2α phosphorylation to drug vehicle, Tm plus salubrinal, Tg and Tg plus salubrinal treatment. It was determined that TDAG51 −/− MEFs have reduced CHOP/GADD153 expression compared to wild type cells. Therefore, TDAG51 knockout may regulate CHOP/GADD153 expression by reducing the phosphorylation of eIF2α, which in turn may lead to decreased expression of GADD34, essentially inhibiting the GADD34/PP1 dephosphorylation complex. This mechanism is also being investigated through the use of siRNA‐mediated knockdown. Supported by CIHR MOP‐67116.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».