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Enregistrement W3174464030 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.988.9

Regulation of PI4KIIα distribution between the Golgi and endosomal compartments

2012· article· en· W3174464030 sur OpenAlexaff
Marko Jović, Naveen Bojjireddy, Michelle J. Kean, Anne‐Claude Gingras, Julie A. Brill, Tamás Balla

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensHospital for Sick ChildrenLunenfeld-Tanenbaum Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndosomeGolgi apparatusCell biologySubcellular localizationNeurodegenerationChemistryBiologyIntracellularEndoplasmic reticulumCytoplasm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphatidylinositol 4‐kinases (PI4Ks) are essential for trafficking along the secretory and degradative routes. The importance of PI4K localization is underscored by the role of PI4KIIα, an enzyme localized to trans‐Golgi and endosomes, in EGF receptor degradation and Wnt signaling, and its suspected role in the late‐onset neurodegeneration. Although membrane association of PI4KIIα through a palmitoyl moiety is suggestive of its cycling between endosomes and Golgi, little is known about the regulation of PI4KIIα subcellular localization. Here we performed a proteomic screen of potential binding partners of PI4KIIα and identified a vesicular fusion protein VAMP‐3, that was confirmed by co‐immunoprecipitation. Expression of Tetanus toxin (TeNT), which specifically cleaves VAMP‐3, resulted in accumulation of PI4KIIα on endosomes. Conversely, overexpression of TeNT with the TeNT‐resistant VAMP‐3 mutant recovered the Golgi localization of PI4KIIα. We also found that PI4KIIα rapidly trafficked back to the Golgi within 2–3 min following photobleaching of the Golgi subpopulation, whereas the rate of its reappearance was significantly decreased in the presence of TeNT. Collectively, these data suggest that VAMP‐3 regulates PI4KIIα retrograde transport, uncovering new aspects of the role of PI4KIIα in human health and disease. Supported by the NICHD Intramural research program

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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