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Enregistrement W3174517000 · doi:10.1096/fasebj.26.1_supplement.145.6

Analysis of Lymphocyte Specific Protein‐1 (LSP‐1) expression in normal primary rat hepatocytes and liver following partial hepatectomy

2012· article· en· W3174517000 sur OpenAlexaff
Kelly Koral, Shirish Paranjpe, Wendy M. Mars, Jan Jongstra, George K. Michalopoulos

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésHepatocyteBiologyHCCSHepatocellular carcinomaMessenger RNALymphocyteGene expressionMolecular biologyGene isoformIn vitroCancer researchGeneImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hepatocellular carcinoma (HCC), the most frequently diagnosed form of liver cancer, is associated with high mortality rates. A recent finding of our laboratory shows that a portion of the gene for lymphocyte‐specific protein 1 (LSP1), an intracellular F‐actin binding protein expressed in neutrophils, macrophages and endothelial cells, is deleted or amplified in a majority of HCCs evaluated. The deletions of LSP‐1 correlated with large tumor size indicating that LSP‐1 may play an inhibitory role in hepatocyte growth. Based on these findings, we hypothesize that LSP‐1 expression is a critical regulator of cellular growth underlying HCC development. However, the expression of LSP‐1 in hepatocytes and normal liver remains to be elucidated. Utilizing immunoblotting and Reverse Transcriptase PCR (RT‐PCR), we examined the total protein and mRNA expression of LSP‐1 in primary rat hepatocytes in vitro and in rat liver tissue after partial hepatectomy. In the rat, LSP‐1 has three known splicing variants; therefore we will examine the expression of the isoforms of LSP‐1 using RT‐PCR with isoform specific LSP‐1 primers. Results from both immunoblotting and RT‐PCR experiments indicate that primary rat hepatocytes and tissue from partial hepatectomized livers express LSP‐1 and that the expression correlates inversely with the rate of growth. Future studies aim to address the function of LSP‐1 in normal and diseased liver states and whether LSP‐1 plays a critical role in hepatocyte growth. Research supported by grant 5T32HL094295‐02.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,246
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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