The <i>PAX‐5</i> transcript is submitted to 3'UTR editing which regulates its oncogenic expression in cancer cells
Notice bibliographique
Résumé
The Pax‐5 oncogene is a major factor in various cancer lesions such as hematopoietic cancers. Recently, we have also shown that Pax‐5 regulates breast cancer phenotypic transitioning processes (EMT‐MET) leading to the regulation of cancer cell malignancy. To date, the aberrant expression of Pax‐5 in cancer cells is still unknown. Our team has thus turned its attention to the post‐transcriptional regulation of Pax‐5 expression by important regulatory elements such as miRNAs and alternative polyadenylation (APA). Upon our analysis of the Pax‐5 transcript in Pax‐5 bearing cells (breast epithelia and B lymphocytes), we found that not only is the 3'UTR submitted to APA; but also, alternative splicing of the Pax‐5 mRNA 3'UTR. Interestingly, upon rapid amplification of cDNA ends (3'RACE) from polysomal fractions, we found that Pax‐5 3'UTR shortening correlates with increased translation frequency. These observations were also validated using reporter gene assays where various truncated 3'UTRs cloned downstream of a luciferase gene resulted in differentially translational expression. More importantly, we also found that Pax‐5 transcripts characterized with shorter 3'UTRs were also associated with advanced staging of hematopoietic cancer lesions. Our findings identify novel molecular mechanisms, which account for Pax‐5 aberrant expression and function in cancer cells. These findings will further elucidate Pax‐5 ‐mediated cancer processes and may provide new avenues for therapeutic intervention. Support or Funding Information This work was supported by grants from the New Brunswick (NB) Innovation Foundation, the Canadian Breast Cancer Foundation, the Canadian Breast Cancer Society/QEII Foundation, the NB Health Research Foundation and by the Beatrice Hunter Cancer Research Institute This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».