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Enregistrement W3174722268 · doi:10.1096/fasebj.2018.32.1_supplement.103.1

Probing the structure, dynamics and regulation of lipid signalling enzymes and their role in human disease

2018· article· en· W3174722268 sur OpenAlexafffundabout
John E. Burke

Notice bibliographique

RevueThe FASEB Journal · 2018
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanadian Institutes of Health ResearchCancer Research Society
Mots-clésKinaseBiologyCell biologyPhosphoinositide 3-kinaseSignal transductionPI3K/AKT/mTOR pathway

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lipid phosphoinositides play fundamental roles in virtually all pathways that control a cell's decision to grow, move, divide, and die. Because of this, kinases that phosphorylate phosphoinositide lipids are critically involved in myriad essential functions including growth, development, and membrane trafficking. The mis‐regulation of the activity of phosphoinositide kinases is critical in human diseases, including cancer, primary immunodeficiencies, developmental disorders, and inflammation. Phosphoinositide kinases also play critical roles in mediating bacterial and viral infection, including many potent human pathogens. Inhibitors of parasite phosphoinositide kinases are in development as therapies for both malaria and cryptosporidiosis. Therefore, understanding how phosphoinositide kinases are regulated has implications for the treatment of many devastating human diseases. My research is focused on understanding the molecular basis for regulation of phosphoinositide kinases, and how they are involved in human disease. We have used a synergy of biophysical approaches involving X‐ray crystallography, hydrogen deuterium exchange mass spectrometry, Cryo‐EM, and biochemical assays to study the structure, dynamics, and molecular interactions of these critical signalling enzymes. I will discuss our work on studying the molecular mechanism of how mutations in phosphoinositide 3‐kinases mediate primary immunodeficiencies and cancer, and how viruses manipulate phosphatidylinositol 4‐kinase protein interaction networks to mediate infection. Overall this work is important in understanding how mis‐regulation of phosphoinositide lipid signals mediate disease. We will also discuss how structural information on these enzymes is being leveraged to generate novel small molecule inhibitors of these enzymes as potential therapeutics for cancer, viral infection, and malaria. Support or Funding Information J.E.B. is supported by the Canadian Institute of Health Research (new investigator grant and CIHR open operating grant FRN 142393), a discovery research grant from the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada (NSERC‐2014‐05218), and a Cancer Research Society operating grant (CRS‐22641). This abstract is from the Experimental Biology 2018 Meeting. There is no full text article associated with this abstract published in The FASEB Journal .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,270 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2018
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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